Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRX5

GINS3, DNA replication complex GINS protein PSF3, humanhuman

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS3Q9BRX5 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GINS3Q9BRX5 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GINS3Q9BRX5 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GINS3Q9BRX5 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GINS3Q9BRX5 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GINS3Q9BRX5 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
GINS3Q9BRX5 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GINS3Q9BRX5 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GINS3Q9BRX5 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GINS3Q9BRX5 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GINS3Q9BRX5 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GINS3Q9BRX5 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GINS3Q9BRX5 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GINS3Q9BRX5 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GINS3Q9BRX5 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GINS3Q9BRX5 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GINS3Q9BRX5 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GINS3Q9BRX5 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
GINS3Q9BRX5 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GINS3Q9BRX5 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GINS3Q9BRX5 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GINS3Q9BRX5 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GINS3Q9BRX5 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GINS3Q9BRX5 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GINS3Q9BRX5 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GINS3Q9BRX5 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GINS3Q9BRX5 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GINS3Q9BRX5 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GINS3Q9BRX5 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GINS3Q9BRX5 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GINS3Q9BRX5 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GINS3Q9BRX5 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
GINS3Q9BRX5 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GINS3Q9BRX5 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GINS3Q9BRX5 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GINS3Q9BRX5 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GINS3Q9BRX5 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GINS3Q9BRX5 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GINS3Q9BRX5 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GINS3Q9BRX5 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GINS3Q9BRX5 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
GINS3Q9BRX5 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GINS3Q9BRX5 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GINS3Q9BRX5 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GINS3Q9BRX5 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GINS3Q9BRX5 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GINS3Q9BRX5 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GINS3Q9BRX5 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
GINS3Q9BRX5 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
GINS3Q9BRX5 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
GINS3Q9BRX5 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GINS3Q9BRX5 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GINS3Q9BRX5 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GINS3Q9BRX5 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GINS3Q9BRX5 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GINS3Q9BRX5 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GINS3Q9BRX5 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GINS3Q9BRX5 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GINS3Q9BRX5 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GINS3Q9BRX5 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GINS3Q9BRX5 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
GINS3Q9BRX5 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GINS3Q9BRX5 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GINS3Q9BRX5 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GINS3Q9BRX5 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GINS3Q9BRX5 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GINS3Q9BRX5 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GINS3Q9BRX5 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GINS3Q9BRX5 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GINS3Q9BRX5 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GINS3Q9BRX5 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GINS3Q9BRX5 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GINS3Q9BRX5 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GINS3Q9BRX5 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GINS3Q9BRX5 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GINS3Q9BRX5 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GINS3Q9BRX5 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GINS3Q9BRX5 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GINS3Q9BRX5 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GINS3Q9BRX5 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
GINS3Q9BRX5 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GINS3Q9BRX5 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GINS3Q9BRX5 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GINS3Q9BRX5 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GINS3Q9BRX5 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GINS3Q9BRX5 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GINS3Q9BRX5 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GINS3Q9BRX5 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GINS3Q9BRX5 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GINS3Q9BRX5 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GINS3Q9BRX5 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GINS3Q9BRX5 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GINS3Q9BRX5 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GINS3Q9BRX5 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
GINS3Q9BRX5 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GINS3Q9BRX5 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GINS3Q9BRX5 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GINS3Q9BRX5 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
GINS3Q9BRX5 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GINS3Q9BRX5 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms