Protein–RNA interactions for Protein: Q96SW2

CRBN, Protein cereblon, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRBNQ96SW2 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CRBNQ96SW2 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CRBNQ96SW2 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CRBNQ96SW2 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CRBNQ96SW2 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CRBNQ96SW2 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CRBNQ96SW2 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CRBNQ96SW2 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CRBNQ96SW2 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CRBNQ96SW2 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CRBNQ96SW2 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CRBNQ96SW2 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CRBNQ96SW2 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CRBNQ96SW2 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CRBNQ96SW2 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CRBNQ96SW2 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CRBNQ96SW2 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CRBNQ96SW2 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CRBNQ96SW2 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CRBNQ96SW2 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CRBNQ96SW2 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CRBNQ96SW2 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
CRBNQ96SW2 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CRBNQ96SW2 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CRBNQ96SW2 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CRBNQ96SW2 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CRBNQ96SW2 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CRBNQ96SW2 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CRBNQ96SW2 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CRBNQ96SW2 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CRBNQ96SW2 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CRBNQ96SW2 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CRBNQ96SW2 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CRBNQ96SW2 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CRBNQ96SW2 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CRBNQ96SW2 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CRBNQ96SW2 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CRBNQ96SW2 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CRBNQ96SW2 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CRBNQ96SW2 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CRBNQ96SW2 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CRBNQ96SW2 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CRBNQ96SW2 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CRBNQ96SW2 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CRBNQ96SW2 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CRBNQ96SW2 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CRBNQ96SW2 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CRBNQ96SW2 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CRBNQ96SW2 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CRBNQ96SW2 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CRBNQ96SW2 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CRBNQ96SW2 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CRBNQ96SW2 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CRBNQ96SW2 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CRBNQ96SW2 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CRBNQ96SW2 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CRBNQ96SW2 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CRBNQ96SW2 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CRBNQ96SW2 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CRBNQ96SW2 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CRBNQ96SW2 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CRBNQ96SW2 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CRBNQ96SW2 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CRBNQ96SW2 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CRBNQ96SW2 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CRBNQ96SW2 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CRBNQ96SW2 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CRBNQ96SW2 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CRBNQ96SW2 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CRBNQ96SW2 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CRBNQ96SW2 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CRBNQ96SW2 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CRBNQ96SW2 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CRBNQ96SW2 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CRBNQ96SW2 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CRBNQ96SW2 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CRBNQ96SW2 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CRBNQ96SW2 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CRBNQ96SW2 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CRBNQ96SW2 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CRBNQ96SW2 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CRBNQ96SW2 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CRBNQ96SW2 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CRBNQ96SW2 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CRBNQ96SW2 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CRBNQ96SW2 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CRBNQ96SW2 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CRBNQ96SW2 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CRBNQ96SW2 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CRBNQ96SW2 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CRBNQ96SW2 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CRBNQ96SW2 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CRBNQ96SW2 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CRBNQ96SW2 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CRBNQ96SW2 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CRBNQ96SW2 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CRBNQ96SW2 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CRBNQ96SW2 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CRBNQ96SW2 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CRBNQ96SW2 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms