Protein–RNA interactions for Protein: Q96MX0

CMTM3, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM3Q96MX0 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CMTM3Q96MX0 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CMTM3Q96MX0 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CMTM3Q96MX0 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CMTM3Q96MX0 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CMTM3Q96MX0 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CMTM3Q96MX0 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CMTM3Q96MX0 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CMTM3Q96MX0 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CMTM3Q96MX0 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CMTM3Q96MX0 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CMTM3Q96MX0 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CMTM3Q96MX0 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CMTM3Q96MX0 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CMTM3Q96MX0 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CMTM3Q96MX0 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CMTM3Q96MX0 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CMTM3Q96MX0 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CMTM3Q96MX0 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CMTM3Q96MX0 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CMTM3Q96MX0 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CMTM3Q96MX0 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CMTM3Q96MX0 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CMTM3Q96MX0 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CMTM3Q96MX0 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CMTM3Q96MX0 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CMTM3Q96MX0 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CMTM3Q96MX0 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CMTM3Q96MX0 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CMTM3Q96MX0 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CMTM3Q96MX0 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CMTM3Q96MX0 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CMTM3Q96MX0 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CMTM3Q96MX0 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CMTM3Q96MX0 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CMTM3Q96MX0 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CMTM3Q96MX0 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CMTM3Q96MX0 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CMTM3Q96MX0 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CMTM3Q96MX0 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CMTM3Q96MX0 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CMTM3Q96MX0 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CMTM3Q96MX0 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CMTM3Q96MX0 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CMTM3Q96MX0 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CMTM3Q96MX0 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CMTM3Q96MX0 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CMTM3Q96MX0 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CMTM3Q96MX0 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CMTM3Q96MX0 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CMTM3Q96MX0 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CMTM3Q96MX0 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CMTM3Q96MX0 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CMTM3Q96MX0 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CMTM3Q96MX0 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CMTM3Q96MX0 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CMTM3Q96MX0 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CMTM3Q96MX0 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CMTM3Q96MX0 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CMTM3Q96MX0 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CMTM3Q96MX0 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CMTM3Q96MX0 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CMTM3Q96MX0 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CMTM3Q96MX0 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CMTM3Q96MX0 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CMTM3Q96MX0 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CMTM3Q96MX0 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CMTM3Q96MX0 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CMTM3Q96MX0 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CMTM3Q96MX0 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CMTM3Q96MX0 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CMTM3Q96MX0 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CMTM3Q96MX0 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CMTM3Q96MX0 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CMTM3Q96MX0 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CMTM3Q96MX0 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CMTM3Q96MX0 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CMTM3Q96MX0 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CMTM3Q96MX0 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CMTM3Q96MX0 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CMTM3Q96MX0 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CMTM3Q96MX0 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CMTM3Q96MX0 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CMTM3Q96MX0 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CMTM3Q96MX0 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CMTM3Q96MX0 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CMTM3Q96MX0 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CMTM3Q96MX0 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CMTM3Q96MX0 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CMTM3Q96MX0 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CMTM3Q96MX0 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CMTM3Q96MX0 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CMTM3Q96MX0 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CMTM3Q96MX0 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CMTM3Q96MX0 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CMTM3Q96MX0 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CMTM3Q96MX0 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CMTM3Q96MX0 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CMTM3Q96MX0 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CMTM3Q96MX0 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms