Protein–RNA interactions for Protein: Q96M83

CCDC7, Coiled-coil domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC7Q96M83 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC7Q96M83 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC7Q96M83 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC7Q96M83 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC7Q96M83 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC7Q96M83 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC7Q96M83 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC7Q96M83 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC7Q96M83 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC7Q96M83 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC7Q96M83 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC7Q96M83 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC7Q96M83 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC7Q96M83 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC7Q96M83 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC7Q96M83 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC7Q96M83 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC7Q96M83 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC7Q96M83 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC7Q96M83 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC7Q96M83 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC7Q96M83 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC7Q96M83 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC7Q96M83 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC7Q96M83 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC7Q96M83 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC7Q96M83 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC7Q96M83 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC7Q96M83 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC7Q96M83 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC7Q96M83 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC7Q96M83 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC7Q96M83 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC7Q96M83 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC7Q96M83 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC7Q96M83 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC7Q96M83 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC7Q96M83 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC7Q96M83 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC7Q96M83 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC7Q96M83 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC7Q96M83 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC7Q96M83 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC7Q96M83 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC7Q96M83 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC7Q96M83 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC7Q96M83 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC7Q96M83 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC7Q96M83 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC7Q96M83 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC7Q96M83 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC7Q96M83 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC7Q96M83 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC7Q96M83 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC7Q96M83 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC7Q96M83 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC7Q96M83 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC7Q96M83 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC7Q96M83 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC7Q96M83 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
CCDC7Q96M83 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CCDC7Q96M83 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CCDC7Q96M83 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CCDC7Q96M83 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
CCDC7Q96M83 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CCDC7Q96M83 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
CCDC7Q96M83 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
CCDC7Q96M83 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CCDC7Q96M83 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CCDC7Q96M83 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
CCDC7Q96M83 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
CCDC7Q96M83 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
CCDC7Q96M83 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC7Q96M83 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC7Q96M83 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC7Q96M83 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC7Q96M83 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC7Q96M83 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC7Q96M83 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC7Q96M83 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC7Q96M83 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC7Q96M83 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC7Q96M83 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC7Q96M83 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC7Q96M83 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC7Q96M83 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC7Q96M83 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC7Q96M83 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC7Q96M83 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC7Q96M83 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC7Q96M83 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC7Q96M83 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC7Q96M83 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC7Q96M83 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC7Q96M83 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC7Q96M83 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC7Q96M83 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC7Q96M83 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC7Q96M83 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC7Q96M83 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms