Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD4

TRIM47, Tripartite motif-containing protein 47, humanhuman

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM47Q96LD4 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM47Q96LD4 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM47Q96LD4 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM47Q96LD4 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM47Q96LD4 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM47Q96LD4 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM47Q96LD4 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM47Q96LD4 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM47Q96LD4 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM47Q96LD4 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM47Q96LD4 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM47Q96LD4 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM47Q96LD4 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM47Q96LD4 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM47Q96LD4 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM47Q96LD4 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM47Q96LD4 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM47Q96LD4 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM47Q96LD4 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM47Q96LD4 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM47Q96LD4 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM47Q96LD4 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM47Q96LD4 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM47Q96LD4 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM47Q96LD4 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM47Q96LD4 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM47Q96LD4 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM47Q96LD4 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM47Q96LD4 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM47Q96LD4 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRIM47Q96LD4 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRIM47Q96LD4 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRIM47Q96LD4 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRIM47Q96LD4 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRIM47Q96LD4 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRIM47Q96LD4 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRIM47Q96LD4 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRIM47Q96LD4 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRIM47Q96LD4 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRIM47Q96LD4 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRIM47Q96LD4 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRIM47Q96LD4 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRIM47Q96LD4 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRIM47Q96LD4 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRIM47Q96LD4 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
TRIM47Q96LD4 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRIM47Q96LD4 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TRIM47Q96LD4 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TRIM47Q96LD4 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM47Q96LD4 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM47Q96LD4 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM47Q96LD4 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM47Q96LD4 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM47Q96LD4 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM47Q96LD4 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM47Q96LD4 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM47Q96LD4 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM47Q96LD4 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM47Q96LD4 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM47Q96LD4 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM47Q96LD4 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM47Q96LD4 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM47Q96LD4 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM47Q96LD4 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM47Q96LD4 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM47Q96LD4 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM47Q96LD4 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM47Q96LD4 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM47Q96LD4 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM47Q96LD4 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM47Q96LD4 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM47Q96LD4 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM47Q96LD4 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM47Q96LD4 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM47Q96LD4 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM47Q96LD4 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM47Q96LD4 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM47Q96LD4 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM47Q96LD4 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM47Q96LD4 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM47Q96LD4 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM47Q96LD4 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM47Q96LD4 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM47Q96LD4 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM47Q96LD4 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM47Q96LD4 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM47Q96LD4 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM47Q96LD4 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM47Q96LD4 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM47Q96LD4 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM47Q96LD4 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM47Q96LD4 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM47Q96LD4 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM47Q96LD4 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM47Q96LD4 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM47Q96LD4 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM47Q96LD4 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM47Q96LD4 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM47Q96LD4 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM47Q96LD4 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms