Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX1

SMIM12, Small integral membrane protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM12Q96EX1 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SMIM12Q96EX1 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SMIM12Q96EX1 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SMIM12Q96EX1 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
SMIM12Q96EX1 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SMIM12Q96EX1 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SMIM12Q96EX1 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SMIM12Q96EX1 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SMIM12Q96EX1 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SMIM12Q96EX1 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SMIM12Q96EX1 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SMIM12Q96EX1 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SMIM12Q96EX1 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SMIM12Q96EX1 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SMIM12Q96EX1 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SMIM12Q96EX1 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SMIM12Q96EX1 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SMIM12Q96EX1 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SMIM12Q96EX1 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SMIM12Q96EX1 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SMIM12Q96EX1 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SMIM12Q96EX1 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SMIM12Q96EX1 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SMIM12Q96EX1 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SMIM12Q96EX1 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SMIM12Q96EX1 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SMIM12Q96EX1 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SMIM12Q96EX1 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SMIM12Q96EX1 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SMIM12Q96EX1 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SMIM12Q96EX1 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SMIM12Q96EX1 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SMIM12Q96EX1 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
SMIM12Q96EX1 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SMIM12Q96EX1 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SMIM12Q96EX1 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SMIM12Q96EX1 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SMIM12Q96EX1 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SMIM12Q96EX1 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SMIM12Q96EX1 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SMIM12Q96EX1 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SMIM12Q96EX1 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SMIM12Q96EX1 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SMIM12Q96EX1 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SMIM12Q96EX1 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SMIM12Q96EX1 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SMIM12Q96EX1 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SMIM12Q96EX1 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
SMIM12Q96EX1 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SMIM12Q96EX1 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SMIM12Q96EX1 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SMIM12Q96EX1 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SMIM12Q96EX1 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SMIM12Q96EX1 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SMIM12Q96EX1 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SMIM12Q96EX1 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SMIM12Q96EX1 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SMIM12Q96EX1 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SMIM12Q96EX1 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SMIM12Q96EX1 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SMIM12Q96EX1 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SMIM12Q96EX1 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SMIM12Q96EX1 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SMIM12Q96EX1 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SMIM12Q96EX1 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SMIM12Q96EX1 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SMIM12Q96EX1 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SMIM12Q96EX1 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SMIM12Q96EX1 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SMIM12Q96EX1 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SMIM12Q96EX1 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SMIM12Q96EX1 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SMIM12Q96EX1 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SMIM12Q96EX1 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SMIM12Q96EX1 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SMIM12Q96EX1 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SMIM12Q96EX1 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SMIM12Q96EX1 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SMIM12Q96EX1 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
SMIM12Q96EX1 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SMIM12Q96EX1 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SMIM12Q96EX1 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SMIM12Q96EX1 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SMIM12Q96EX1 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
SMIM12Q96EX1 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
SMIM12Q96EX1 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SMIM12Q96EX1 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SMIM12Q96EX1 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SMIM12Q96EX1 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SMIM12Q96EX1 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SMIM12Q96EX1 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SMIM12Q96EX1 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SMIM12Q96EX1 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SMIM12Q96EX1 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SMIM12Q96EX1 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SMIM12Q96EX1 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SMIM12Q96EX1 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SMIM12Q96EX1 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SMIM12Q96EX1 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SMIM12Q96EX1 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms