Protein–RNA interactions for Protein: Q96BQ1

FAM3D, Protein FAM3D, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3DQ96BQ1 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM3DQ96BQ1 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM3DQ96BQ1 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM3DQ96BQ1 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM3DQ96BQ1 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM3DQ96BQ1 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM3DQ96BQ1 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM3DQ96BQ1 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM3DQ96BQ1 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM3DQ96BQ1 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM3DQ96BQ1 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM3DQ96BQ1 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM3DQ96BQ1 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM3DQ96BQ1 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM3DQ96BQ1 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM3DQ96BQ1 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM3DQ96BQ1 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM3DQ96BQ1 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM3DQ96BQ1 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM3DQ96BQ1 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM3DQ96BQ1 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM3DQ96BQ1 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM3DQ96BQ1 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM3DQ96BQ1 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM3DQ96BQ1 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM3DQ96BQ1 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM3DQ96BQ1 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM3DQ96BQ1 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM3DQ96BQ1 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM3DQ96BQ1 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM3DQ96BQ1 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM3DQ96BQ1 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM3DQ96BQ1 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM3DQ96BQ1 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM3DQ96BQ1 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM3DQ96BQ1 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM3DQ96BQ1 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM3DQ96BQ1 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM3DQ96BQ1 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM3DQ96BQ1 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM3DQ96BQ1 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
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FAM3DQ96BQ1 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FAM3DQ96BQ1 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FAM3DQ96BQ1 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FAM3DQ96BQ1 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FAM3DQ96BQ1 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FAM3DQ96BQ1 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FAM3DQ96BQ1 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FAM3DQ96BQ1 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FAM3DQ96BQ1 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FAM3DQ96BQ1 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FAM3DQ96BQ1 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FAM3DQ96BQ1 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FAM3DQ96BQ1 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FAM3DQ96BQ1 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FAM3DQ96BQ1 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FAM3DQ96BQ1 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FAM3DQ96BQ1 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FAM3DQ96BQ1 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FAM3DQ96BQ1 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FAM3DQ96BQ1 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FAM3DQ96BQ1 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FAM3DQ96BQ1 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
FAM3DQ96BQ1 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FAM3DQ96BQ1 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
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FAM3DQ96BQ1 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM3DQ96BQ1 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM3DQ96BQ1 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM3DQ96BQ1 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM3DQ96BQ1 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM3DQ96BQ1 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM3DQ96BQ1 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM3DQ96BQ1 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM3DQ96BQ1 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM3DQ96BQ1 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM3DQ96BQ1 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM3DQ96BQ1 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM3DQ96BQ1 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM3DQ96BQ1 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM3DQ96BQ1 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM3DQ96BQ1 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM3DQ96BQ1 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM3DQ96BQ1 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM3DQ96BQ1 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM3DQ96BQ1 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM3DQ96BQ1 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM3DQ96BQ1 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM3DQ96BQ1 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM3DQ96BQ1 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM3DQ96BQ1 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM3DQ96BQ1 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM3DQ96BQ1 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM3DQ96BQ1 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM3DQ96BQ1 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM3DQ96BQ1 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
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