Protein–RNA interactions for Protein: Q96B26

EXOSC8, Exosome complex component RRP43, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC8Q96B26 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
EXOSC8Q96B26 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
EXOSC8Q96B26 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
EXOSC8Q96B26 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
EXOSC8Q96B26 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
EXOSC8Q96B26 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
EXOSC8Q96B26 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
EXOSC8Q96B26 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
EXOSC8Q96B26 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
EXOSC8Q96B26 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
EXOSC8Q96B26 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
EXOSC8Q96B26 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
EXOSC8Q96B26 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
EXOSC8Q96B26 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
EXOSC8Q96B26 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
EXOSC8Q96B26 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
EXOSC8Q96B26 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
EXOSC8Q96B26 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
EXOSC8Q96B26 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
EXOSC8Q96B26 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
EXOSC8Q96B26 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
EXOSC8Q96B26 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
EXOSC8Q96B26 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
EXOSC8Q96B26 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
EXOSC8Q96B26 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
EXOSC8Q96B26 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
EXOSC8Q96B26 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
EXOSC8Q96B26 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
EXOSC8Q96B26 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
EXOSC8Q96B26 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
EXOSC8Q96B26 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
EXOSC8Q96B26 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
EXOSC8Q96B26 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
EXOSC8Q96B26 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
EXOSC8Q96B26 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
EXOSC8Q96B26 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
EXOSC8Q96B26 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
EXOSC8Q96B26 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
EXOSC8Q96B26 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
EXOSC8Q96B26 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
EXOSC8Q96B26 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
EXOSC8Q96B26 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
EXOSC8Q96B26 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
EXOSC8Q96B26 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
EXOSC8Q96B26 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
EXOSC8Q96B26 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
EXOSC8Q96B26 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
EXOSC8Q96B26 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
EXOSC8Q96B26 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
EXOSC8Q96B26 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
EXOSC8Q96B26 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
EXOSC8Q96B26 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
EXOSC8Q96B26 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
EXOSC8Q96B26 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
EXOSC8Q96B26 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
EXOSC8Q96B26 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
EXOSC8Q96B26 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
EXOSC8Q96B26 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
EXOSC8Q96B26 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
EXOSC8Q96B26 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
EXOSC8Q96B26 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
EXOSC8Q96B26 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
EXOSC8Q96B26 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
EXOSC8Q96B26 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
EXOSC8Q96B26 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
EXOSC8Q96B26 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
EXOSC8Q96B26 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
EXOSC8Q96B26 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
EXOSC8Q96B26 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
EXOSC8Q96B26 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
EXOSC8Q96B26 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
EXOSC8Q96B26 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
EXOSC8Q96B26 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
EXOSC8Q96B26 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
EXOSC8Q96B26 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
EXOSC8Q96B26 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
EXOSC8Q96B26 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
EXOSC8Q96B26 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
EXOSC8Q96B26 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
EXOSC8Q96B26 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
EXOSC8Q96B26 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
EXOSC8Q96B26 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
EXOSC8Q96B26 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
EXOSC8Q96B26 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
EXOSC8Q96B26 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
EXOSC8Q96B26 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
EXOSC8Q96B26 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
EXOSC8Q96B26 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
EXOSC8Q96B26 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
EXOSC8Q96B26 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
EXOSC8Q96B26 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
EXOSC8Q96B26 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
EXOSC8Q96B26 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
EXOSC8Q96B26 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
EXOSC8Q96B26 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
EXOSC8Q96B26 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
EXOSC8Q96B26 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
EXOSC8Q96B26 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
EXOSC8Q96B26 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
EXOSC8Q96B26 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms