Protein–RNA interactions for Protein: Q8N987

NECAB1, N-terminal EF-hand calcium-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NECAB1Q8N987 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NECAB1Q8N987 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NECAB1Q8N987 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NECAB1Q8N987 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NECAB1Q8N987 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NECAB1Q8N987 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NECAB1Q8N987 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
NECAB1Q8N987 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NECAB1Q8N987 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NECAB1Q8N987 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NECAB1Q8N987 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NECAB1Q8N987 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NECAB1Q8N987 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NECAB1Q8N987 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NECAB1Q8N987 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NECAB1Q8N987 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NECAB1Q8N987 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NECAB1Q8N987 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NECAB1Q8N987 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NECAB1Q8N987 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NECAB1Q8N987 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NECAB1Q8N987 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NECAB1Q8N987 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NECAB1Q8N987 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NECAB1Q8N987 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NECAB1Q8N987 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NECAB1Q8N987 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NECAB1Q8N987 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
NECAB1Q8N987 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NECAB1Q8N987 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NECAB1Q8N987 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NECAB1Q8N987 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NECAB1Q8N987 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NECAB1Q8N987 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NECAB1Q8N987 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NECAB1Q8N987 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NECAB1Q8N987 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NECAB1Q8N987 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NECAB1Q8N987 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NECAB1Q8N987 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NECAB1Q8N987 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NECAB1Q8N987 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NECAB1Q8N987 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NECAB1Q8N987 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NECAB1Q8N987 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NECAB1Q8N987 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NECAB1Q8N987 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NECAB1Q8N987 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NECAB1Q8N987 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NECAB1Q8N987 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NECAB1Q8N987 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NECAB1Q8N987 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NECAB1Q8N987 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NECAB1Q8N987 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NECAB1Q8N987 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NECAB1Q8N987 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NECAB1Q8N987 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NECAB1Q8N987 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NECAB1Q8N987 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NECAB1Q8N987 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NECAB1Q8N987 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NECAB1Q8N987 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
NECAB1Q8N987 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NECAB1Q8N987 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NECAB1Q8N987 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NECAB1Q8N987 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NECAB1Q8N987 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NECAB1Q8N987 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NECAB1Q8N987 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NECAB1Q8N987 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NECAB1Q8N987 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NECAB1Q8N987 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NECAB1Q8N987 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NECAB1Q8N987 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NECAB1Q8N987 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NECAB1Q8N987 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NECAB1Q8N987 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NECAB1Q8N987 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NECAB1Q8N987 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
NECAB1Q8N987 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NECAB1Q8N987 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NECAB1Q8N987 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NECAB1Q8N987 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NECAB1Q8N987 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NECAB1Q8N987 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NECAB1Q8N987 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NECAB1Q8N987 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NECAB1Q8N987 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NECAB1Q8N987 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NECAB1Q8N987 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NECAB1Q8N987 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NECAB1Q8N987 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NECAB1Q8N987 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
NECAB1Q8N987 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
NECAB1Q8N987 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NECAB1Q8N987 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NECAB1Q8N987 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NECAB1Q8N987 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NECAB1Q8N987 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NECAB1Q8N987 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms