Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z398

ZNF550, Zinc finger protein 550, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF550Q7Z398 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ZNF550Q7Z398 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ZNF550Q7Z398 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ZNF550Q7Z398 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ZNF550Q7Z398 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ZNF550Q7Z398 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ZNF550Q7Z398 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ZNF550Q7Z398 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ZNF550Q7Z398 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
ZNF550Q7Z398 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ZNF550Q7Z398 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ZNF550Q7Z398 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ZNF550Q7Z398 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ZNF550Q7Z398 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ZNF550Q7Z398 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
ZNF550Q7Z398 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ZNF550Q7Z398 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ZNF550Q7Z398 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ZNF550Q7Z398 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ZNF550Q7Z398 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ZNF550Q7Z398 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ZNF550Q7Z398 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ZNF550Q7Z398 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ZNF550Q7Z398 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ZNF550Q7Z398 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ZNF550Q7Z398 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ZNF550Q7Z398 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ZNF550Q7Z398 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZNF550Q7Z398 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZNF550Q7Z398 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZNF550Q7Z398 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZNF550Q7Z398 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
ZNF550Q7Z398 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZNF550Q7Z398 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZNF550Q7Z398 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZNF550Q7Z398 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZNF550Q7Z398 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZNF550Q7Z398 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZNF550Q7Z398 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZNF550Q7Z398 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZNF550Q7Z398 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZNF550Q7Z398 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZNF550Q7Z398 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZNF550Q7Z398 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZNF550Q7Z398 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
ZNF550Q7Z398 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZNF550Q7Z398 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZNF550Q7Z398 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZNF550Q7Z398 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZNF550Q7Z398 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZNF550Q7Z398 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZNF550Q7Z398 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZNF550Q7Z398 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZNF550Q7Z398 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZNF550Q7Z398 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZNF550Q7Z398 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZNF550Q7Z398 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZNF550Q7Z398 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZNF550Q7Z398 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ZNF550Q7Z398 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ZNF550Q7Z398 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ZNF550Q7Z398 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.41
ZNF550Q7Z398 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
ZNF550Q7Z398 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ZNF550Q7Z398 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ZNF550Q7Z398 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ZNF550Q7Z398 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ZNF550Q7Z398 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ZNF550Q7Z398 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ZNF550Q7Z398 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ZNF550Q7Z398 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ZNF550Q7Z398 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ZNF550Q7Z398 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ZNF550Q7Z398 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
ZNF550Q7Z398 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ZNF550Q7Z398 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ZNF550Q7Z398 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ZNF550Q7Z398 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ZNF550Q7Z398 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ZNF550Q7Z398 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ZNF550Q7Z398 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ZNF550Q7Z398 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ZNF550Q7Z398 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ZNF550Q7Z398 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZNF550Q7Z398 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZNF550Q7Z398 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZNF550Q7Z398 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZNF550Q7Z398 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZNF550Q7Z398 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZNF550Q7Z398 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZNF550Q7Z398 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZNF550Q7Z398 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZNF550Q7Z398 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZNF550Q7Z398 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZNF550Q7Z398 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZNF550Q7Z398 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZNF550Q7Z398 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZNF550Q7Z398 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZNF550Q7Z398 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZNF550Q7Z398 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 152.2 ms