Protein–RNA interactions for Protein: Q6TDU7

CASC1, Protein CASC1, humanhuman

Predictions only

Length 716 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASC1Q6TDU7 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CASC1Q6TDU7 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CASC1Q6TDU7 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CASC1Q6TDU7 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CASC1Q6TDU7 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CASC1Q6TDU7 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CASC1Q6TDU7 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CASC1Q6TDU7 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CASC1Q6TDU7 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CASC1Q6TDU7 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CASC1Q6TDU7 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CASC1Q6TDU7 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CASC1Q6TDU7 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CASC1Q6TDU7 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CASC1Q6TDU7 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CASC1Q6TDU7 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CASC1Q6TDU7 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CASC1Q6TDU7 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CASC1Q6TDU7 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CASC1Q6TDU7 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CASC1Q6TDU7 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CASC1Q6TDU7 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CASC1Q6TDU7 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CASC1Q6TDU7 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CASC1Q6TDU7 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CASC1Q6TDU7 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CASC1Q6TDU7 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CASC1Q6TDU7 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CASC1Q6TDU7 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CASC1Q6TDU7 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CASC1Q6TDU7 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CASC1Q6TDU7 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CASC1Q6TDU7 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CASC1Q6TDU7 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CASC1Q6TDU7 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CASC1Q6TDU7 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CASC1Q6TDU7 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CASC1Q6TDU7 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CASC1Q6TDU7 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CASC1Q6TDU7 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CASC1Q6TDU7 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CASC1Q6TDU7 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CASC1Q6TDU7 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CASC1Q6TDU7 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CASC1Q6TDU7 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CASC1Q6TDU7 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CASC1Q6TDU7 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CASC1Q6TDU7 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CASC1Q6TDU7 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CASC1Q6TDU7 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CASC1Q6TDU7 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CASC1Q6TDU7 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CASC1Q6TDU7 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CASC1Q6TDU7 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CASC1Q6TDU7 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CASC1Q6TDU7 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CASC1Q6TDU7 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CASC1Q6TDU7 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CASC1Q6TDU7 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CASC1Q6TDU7 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CASC1Q6TDU7 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CASC1Q6TDU7 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CASC1Q6TDU7 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CASC1Q6TDU7 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CASC1Q6TDU7 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CASC1Q6TDU7 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CASC1Q6TDU7 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CASC1Q6TDU7 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CASC1Q6TDU7 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CASC1Q6TDU7 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CASC1Q6TDU7 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CASC1Q6TDU7 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CASC1Q6TDU7 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CASC1Q6TDU7 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CASC1Q6TDU7 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CASC1Q6TDU7 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CASC1Q6TDU7 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CASC1Q6TDU7 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CASC1Q6TDU7 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CASC1Q6TDU7 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CASC1Q6TDU7 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CASC1Q6TDU7 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CASC1Q6TDU7 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CASC1Q6TDU7 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CASC1Q6TDU7 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CASC1Q6TDU7 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CASC1Q6TDU7 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CASC1Q6TDU7 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CASC1Q6TDU7 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CASC1Q6TDU7 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CASC1Q6TDU7 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CASC1Q6TDU7 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CASC1Q6TDU7 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CASC1Q6TDU7 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CASC1Q6TDU7 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CASC1Q6TDU7 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CASC1Q6TDU7 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CASC1Q6TDU7 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CASC1Q6TDU7 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CASC1Q6TDU7 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms