Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEY1

TMEM88, Transmembrane protein 88, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM88Q6PEY1 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM88Q6PEY1 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM88Q6PEY1 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM88Q6PEY1 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM88Q6PEY1 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM88Q6PEY1 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM88Q6PEY1 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM88Q6PEY1 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM88Q6PEY1 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM88Q6PEY1 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM88Q6PEY1 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM88Q6PEY1 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM88Q6PEY1 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM88Q6PEY1 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM88Q6PEY1 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM88Q6PEY1 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM88Q6PEY1 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM88Q6PEY1 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM88Q6PEY1 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM88Q6PEY1 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM88Q6PEY1 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM88Q6PEY1 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM88Q6PEY1 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM88Q6PEY1 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM88Q6PEY1 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM88Q6PEY1 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM88Q6PEY1 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM88Q6PEY1 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM88Q6PEY1 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM88Q6PEY1 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM88Q6PEY1 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM88Q6PEY1 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM88Q6PEY1 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM88Q6PEY1 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM88Q6PEY1 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM88Q6PEY1 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM88Q6PEY1 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM88Q6PEY1 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM88Q6PEY1 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM88Q6PEY1 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM88Q6PEY1 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM88Q6PEY1 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM88Q6PEY1 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM88Q6PEY1 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM88Q6PEY1 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM88Q6PEY1 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM88Q6PEY1 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM88Q6PEY1 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM88Q6PEY1 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM88Q6PEY1 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM88Q6PEY1 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM88Q6PEY1 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM88Q6PEY1 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM88Q6PEY1 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM88Q6PEY1 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM88Q6PEY1 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM88Q6PEY1 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM88Q6PEY1 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM88Q6PEY1 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM88Q6PEY1 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM88Q6PEY1 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM88Q6PEY1 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM88Q6PEY1 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM88Q6PEY1 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM88Q6PEY1 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM88Q6PEY1 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM88Q6PEY1 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM88Q6PEY1 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM88Q6PEY1 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM88Q6PEY1 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM88Q6PEY1 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM88Q6PEY1 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM88Q6PEY1 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM88Q6PEY1 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM88Q6PEY1 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM88Q6PEY1 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM88Q6PEY1 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM88Q6PEY1 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM88Q6PEY1 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM88Q6PEY1 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM88Q6PEY1 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM88Q6PEY1 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM88Q6PEY1 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM88Q6PEY1 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM88Q6PEY1 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM88Q6PEY1 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM88Q6PEY1 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM88Q6PEY1 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM88Q6PEY1 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM88Q6PEY1 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM88Q6PEY1 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM88Q6PEY1 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM88Q6PEY1 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM88Q6PEY1 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM88Q6PEY1 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM88Q6PEY1 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM88Q6PEY1 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM88Q6PEY1 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM88Q6PEY1 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM88Q6PEY1 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms