Protein–RNA interactions for Protein: Q6P435

Putative uncharacterized SMG1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6P435 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Q6P435 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Q6P435 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q6P435 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q6P435 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q6P435 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q6P435 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Q6P435 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Q6P435 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Q6P435 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Q6P435 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q6P435 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Q6P435 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q6P435 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Q6P435 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Q6P435 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Q6P435 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q6P435 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Q6P435 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Q6P435 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Q6P435 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC16■□□□□ 0.15
Q6P435 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Q6P435 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Q6P435 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Q6P435 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q6P435 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q6P435 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q6P435 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q6P435 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q6P435 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q6P435 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q6P435 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q6P435 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q6P435 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q6P435 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q6P435 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q6P435 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q6P435 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q6P435 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q6P435 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q6P435 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q6P435 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q6P435 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q6P435 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q6P435 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q6P435 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q6P435 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q6P435 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Q6P435 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q6P435 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q6P435 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q6P435 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q6P435 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Q6P435 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q6P435 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q6P435 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q6P435 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q6P435 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q6P435 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q6P435 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q6P435 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Q6P435 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q6P435 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q6P435 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q6P435 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q6P435 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Q6P435 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q6P435 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q6P435 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q6P435 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q6P435 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q6P435 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q6P435 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q6P435 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q6P435 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q6P435 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q6P435 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q6P435 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q6P435 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q6P435 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q6P435 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Q6P435 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q6P435 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q6P435 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q6P435 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q6P435 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q6P435 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q6P435 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q6P435 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q6P435 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q6P435 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q6P435 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q6P435 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q6P435 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q6P435 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q6P435 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q6P435 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q6P435 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q6P435 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q6P435 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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