Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZI2

CAVIN1, Caveolae-associated protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN1Q6NZI2 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CAVIN1Q6NZI2 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CAVIN1Q6NZI2 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CAVIN1Q6NZI2 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CAVIN1Q6NZI2 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CAVIN1Q6NZI2 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CAVIN1Q6NZI2 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CAVIN1Q6NZI2 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CAVIN1Q6NZI2 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CAVIN1Q6NZI2 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CAVIN1Q6NZI2 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CAVIN1Q6NZI2 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CAVIN1Q6NZI2 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CAVIN1Q6NZI2 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CAVIN1Q6NZI2 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CAVIN1Q6NZI2 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CAVIN1Q6NZI2 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CAVIN1Q6NZI2 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CAVIN1Q6NZI2 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CAVIN1Q6NZI2 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CAVIN1Q6NZI2 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CAVIN1Q6NZI2 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CAVIN1Q6NZI2 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CAVIN1Q6NZI2 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CAVIN1Q6NZI2 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CAVIN1Q6NZI2 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CAVIN1Q6NZI2 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CAVIN1Q6NZI2 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CAVIN1Q6NZI2 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CAVIN1Q6NZI2 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CAVIN1Q6NZI2 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CAVIN1Q6NZI2 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CAVIN1Q6NZI2 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
CAVIN1Q6NZI2 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
CAVIN1Q6NZI2 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
CAVIN1Q6NZI2 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
CAVIN1Q6NZI2 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CAVIN1Q6NZI2 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CAVIN1Q6NZI2 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CAVIN1Q6NZI2 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CAVIN1Q6NZI2 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CAVIN1Q6NZI2 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CAVIN1Q6NZI2 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CAVIN1Q6NZI2 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CAVIN1Q6NZI2 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CAVIN1Q6NZI2 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CAVIN1Q6NZI2 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CAVIN1Q6NZI2 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CAVIN1Q6NZI2 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CAVIN1Q6NZI2 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CAVIN1Q6NZI2 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CAVIN1Q6NZI2 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CAVIN1Q6NZI2 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CAVIN1Q6NZI2 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CAVIN1Q6NZI2 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CAVIN1Q6NZI2 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CAVIN1Q6NZI2 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CAVIN1Q6NZI2 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CAVIN1Q6NZI2 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CAVIN1Q6NZI2 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CAVIN1Q6NZI2 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CAVIN1Q6NZI2 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CAVIN1Q6NZI2 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CAVIN1Q6NZI2 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CAVIN1Q6NZI2 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CAVIN1Q6NZI2 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CAVIN1Q6NZI2 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CAVIN1Q6NZI2 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CAVIN1Q6NZI2 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CAVIN1Q6NZI2 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CAVIN1Q6NZI2 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CAVIN1Q6NZI2 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CAVIN1Q6NZI2 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CAVIN1Q6NZI2 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CAVIN1Q6NZI2 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CAVIN1Q6NZI2 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CAVIN1Q6NZI2 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CAVIN1Q6NZI2 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CAVIN1Q6NZI2 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CAVIN1Q6NZI2 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CAVIN1Q6NZI2 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CAVIN1Q6NZI2 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CAVIN1Q6NZI2 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CAVIN1Q6NZI2 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CAVIN1Q6NZI2 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CAVIN1Q6NZI2 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CAVIN1Q6NZI2 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CAVIN1Q6NZI2 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CAVIN1Q6NZI2 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CAVIN1Q6NZI2 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CAVIN1Q6NZI2 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CAVIN1Q6NZI2 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CAVIN1Q6NZI2 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CAVIN1Q6NZI2 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CAVIN1Q6NZI2 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CAVIN1Q6NZI2 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CAVIN1Q6NZI2 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CAVIN1Q6NZI2 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CAVIN1Q6NZI2 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CAVIN1Q6NZI2 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms