Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSW7

NANOGP8, Putative homeobox protein NANOGP8, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NANOGP8Q6NSW7 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NANOGP8Q6NSW7 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NANOGP8Q6NSW7 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NANOGP8Q6NSW7 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NANOGP8Q6NSW7 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NANOGP8Q6NSW7 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NANOGP8Q6NSW7 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
NANOGP8Q6NSW7 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
NANOGP8Q6NSW7 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
NANOGP8Q6NSW7 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
NANOGP8Q6NSW7 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
NANOGP8Q6NSW7 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
NANOGP8Q6NSW7 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
NANOGP8Q6NSW7 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NANOGP8Q6NSW7 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NANOGP8Q6NSW7 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NANOGP8Q6NSW7 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NANOGP8Q6NSW7 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
NANOGP8Q6NSW7 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NANOGP8Q6NSW7 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NANOGP8Q6NSW7 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NANOGP8Q6NSW7 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NANOGP8Q6NSW7 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NANOGP8Q6NSW7 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NANOGP8Q6NSW7 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NANOGP8Q6NSW7 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NANOGP8Q6NSW7 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NANOGP8Q6NSW7 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NANOGP8Q6NSW7 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
NANOGP8Q6NSW7 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
NANOGP8Q6NSW7 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
NANOGP8Q6NSW7 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NANOGP8Q6NSW7 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NANOGP8Q6NSW7 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NANOGP8Q6NSW7 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NANOGP8Q6NSW7 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NANOGP8Q6NSW7 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NANOGP8Q6NSW7 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NANOGP8Q6NSW7 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NANOGP8Q6NSW7 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NANOGP8Q6NSW7 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NANOGP8Q6NSW7 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NANOGP8Q6NSW7 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NANOGP8Q6NSW7 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NANOGP8Q6NSW7 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NANOGP8Q6NSW7 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NANOGP8Q6NSW7 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NANOGP8Q6NSW7 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NANOGP8Q6NSW7 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NANOGP8Q6NSW7 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NANOGP8Q6NSW7 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NANOGP8Q6NSW7 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NANOGP8Q6NSW7 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NANOGP8Q6NSW7 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NANOGP8Q6NSW7 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NANOGP8Q6NSW7 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NANOGP8Q6NSW7 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NANOGP8Q6NSW7 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NANOGP8Q6NSW7 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NANOGP8Q6NSW7 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NANOGP8Q6NSW7 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NANOGP8Q6NSW7 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NANOGP8Q6NSW7 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NANOGP8Q6NSW7 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NANOGP8Q6NSW7 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
NANOGP8Q6NSW7 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NANOGP8Q6NSW7 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NANOGP8Q6NSW7 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NANOGP8Q6NSW7 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NANOGP8Q6NSW7 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NANOGP8Q6NSW7 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NANOGP8Q6NSW7 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NANOGP8Q6NSW7 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NANOGP8Q6NSW7 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NANOGP8Q6NSW7 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NANOGP8Q6NSW7 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NANOGP8Q6NSW7 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NANOGP8Q6NSW7 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NANOGP8Q6NSW7 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NANOGP8Q6NSW7 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NANOGP8Q6NSW7 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
NANOGP8Q6NSW7 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NANOGP8Q6NSW7 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NANOGP8Q6NSW7 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NANOGP8Q6NSW7 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NANOGP8Q6NSW7 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NANOGP8Q6NSW7 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NANOGP8Q6NSW7 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NANOGP8Q6NSW7 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NANOGP8Q6NSW7 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NANOGP8Q6NSW7 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NANOGP8Q6NSW7 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NANOGP8Q6NSW7 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NANOGP8Q6NSW7 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NANOGP8Q6NSW7 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NANOGP8Q6NSW7 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NANOGP8Q6NSW7 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NANOGP8Q6NSW7 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NANOGP8Q6NSW7 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NANOGP8Q6NSW7 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms