Protein–RNA interactions for Protein: Q5VYV7

SLX4IP, Protein SLX4IP, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLX4IPQ5VYV7 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SLX4IPQ5VYV7 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SLX4IPQ5VYV7 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SLX4IPQ5VYV7 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SLX4IPQ5VYV7 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SLX4IPQ5VYV7 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLX4IPQ5VYV7 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLX4IPQ5VYV7 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLX4IPQ5VYV7 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLX4IPQ5VYV7 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLX4IPQ5VYV7 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLX4IPQ5VYV7 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLX4IPQ5VYV7 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLX4IPQ5VYV7 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLX4IPQ5VYV7 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLX4IPQ5VYV7 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLX4IPQ5VYV7 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLX4IPQ5VYV7 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLX4IPQ5VYV7 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLX4IPQ5VYV7 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLX4IPQ5VYV7 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLX4IPQ5VYV7 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SLX4IPQ5VYV7 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLX4IPQ5VYV7 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLX4IPQ5VYV7 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLX4IPQ5VYV7 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SLX4IPQ5VYV7 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLX4IPQ5VYV7 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLX4IPQ5VYV7 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLX4IPQ5VYV7 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLX4IPQ5VYV7 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLX4IPQ5VYV7 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLX4IPQ5VYV7 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLX4IPQ5VYV7 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLX4IPQ5VYV7 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLX4IPQ5VYV7 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLX4IPQ5VYV7 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLX4IPQ5VYV7 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLX4IPQ5VYV7 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLX4IPQ5VYV7 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLX4IPQ5VYV7 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLX4IPQ5VYV7 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLX4IPQ5VYV7 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLX4IPQ5VYV7 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLX4IPQ5VYV7 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLX4IPQ5VYV7 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLX4IPQ5VYV7 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SLX4IPQ5VYV7 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLX4IPQ5VYV7 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLX4IPQ5VYV7 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLX4IPQ5VYV7 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLX4IPQ5VYV7 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLX4IPQ5VYV7 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLX4IPQ5VYV7 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLX4IPQ5VYV7 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLX4IPQ5VYV7 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLX4IPQ5VYV7 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLX4IPQ5VYV7 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLX4IPQ5VYV7 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLX4IPQ5VYV7 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLX4IPQ5VYV7 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLX4IPQ5VYV7 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLX4IPQ5VYV7 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLX4IPQ5VYV7 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLX4IPQ5VYV7 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLX4IPQ5VYV7 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLX4IPQ5VYV7 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLX4IPQ5VYV7 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLX4IPQ5VYV7 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLX4IPQ5VYV7 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLX4IPQ5VYV7 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SLX4IPQ5VYV7 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLX4IPQ5VYV7 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLX4IPQ5VYV7 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLX4IPQ5VYV7 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLX4IPQ5VYV7 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLX4IPQ5VYV7 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLX4IPQ5VYV7 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLX4IPQ5VYV7 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLX4IPQ5VYV7 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLX4IPQ5VYV7 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLX4IPQ5VYV7 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SLX4IPQ5VYV7 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLX4IPQ5VYV7 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLX4IPQ5VYV7 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SLX4IPQ5VYV7 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLX4IPQ5VYV7 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SLX4IPQ5VYV7 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLX4IPQ5VYV7 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLX4IPQ5VYV7 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLX4IPQ5VYV7 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLX4IPQ5VYV7 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLX4IPQ5VYV7 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLX4IPQ5VYV7 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLX4IPQ5VYV7 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLX4IPQ5VYV7 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLX4IPQ5VYV7 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLX4IPQ5VYV7 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLX4IPQ5VYV7 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLX4IPQ5VYV7 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms