Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSY0

GKAP1, G kinase-anchoring protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GKAP1Q5VSY0 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GKAP1Q5VSY0 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
GKAP1Q5VSY0 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GKAP1Q5VSY0 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GKAP1Q5VSY0 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GKAP1Q5VSY0 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GKAP1Q5VSY0 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
GKAP1Q5VSY0 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GKAP1Q5VSY0 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GKAP1Q5VSY0 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GKAP1Q5VSY0 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GKAP1Q5VSY0 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GKAP1Q5VSY0 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GKAP1Q5VSY0 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GKAP1Q5VSY0 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GKAP1Q5VSY0 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GKAP1Q5VSY0 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GKAP1Q5VSY0 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GKAP1Q5VSY0 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GKAP1Q5VSY0 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GKAP1Q5VSY0 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GKAP1Q5VSY0 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GKAP1Q5VSY0 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GKAP1Q5VSY0 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GKAP1Q5VSY0 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GKAP1Q5VSY0 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GKAP1Q5VSY0 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GKAP1Q5VSY0 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GKAP1Q5VSY0 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GKAP1Q5VSY0 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GKAP1Q5VSY0 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GKAP1Q5VSY0 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
GKAP1Q5VSY0 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GKAP1Q5VSY0 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GKAP1Q5VSY0 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GKAP1Q5VSY0 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GKAP1Q5VSY0 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GKAP1Q5VSY0 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GKAP1Q5VSY0 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GKAP1Q5VSY0 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GKAP1Q5VSY0 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GKAP1Q5VSY0 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GKAP1Q5VSY0 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GKAP1Q5VSY0 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GKAP1Q5VSY0 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GKAP1Q5VSY0 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GKAP1Q5VSY0 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GKAP1Q5VSY0 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GKAP1Q5VSY0 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GKAP1Q5VSY0 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GKAP1Q5VSY0 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GKAP1Q5VSY0 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GKAP1Q5VSY0 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GKAP1Q5VSY0 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GKAP1Q5VSY0 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GKAP1Q5VSY0 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GKAP1Q5VSY0 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GKAP1Q5VSY0 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GKAP1Q5VSY0 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GKAP1Q5VSY0 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
GKAP1Q5VSY0 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GKAP1Q5VSY0 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GKAP1Q5VSY0 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GKAP1Q5VSY0 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GKAP1Q5VSY0 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GKAP1Q5VSY0 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GKAP1Q5VSY0 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GKAP1Q5VSY0 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
GKAP1Q5VSY0 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GKAP1Q5VSY0 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GKAP1Q5VSY0 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GKAP1Q5VSY0 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GKAP1Q5VSY0 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GKAP1Q5VSY0 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GKAP1Q5VSY0 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GKAP1Q5VSY0 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GKAP1Q5VSY0 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
GKAP1Q5VSY0 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GKAP1Q5VSY0 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GKAP1Q5VSY0 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GKAP1Q5VSY0 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GKAP1Q5VSY0 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GKAP1Q5VSY0 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GKAP1Q5VSY0 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GKAP1Q5VSY0 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GKAP1Q5VSY0 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GKAP1Q5VSY0 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GKAP1Q5VSY0 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GKAP1Q5VSY0 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GKAP1Q5VSY0 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GKAP1Q5VSY0 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GKAP1Q5VSY0 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
GKAP1Q5VSY0 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GKAP1Q5VSY0 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GKAP1Q5VSY0 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GKAP1Q5VSY0 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GKAP1Q5VSY0 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GKAP1Q5VSY0 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GKAP1Q5VSY0 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GKAP1Q5VSY0 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms