Protein–RNA interactions for Protein: Q5T9A4

ATAD3B, ATPase family AAA domain-containing protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 648 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATAD3BQ5T9A4 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATAD3BQ5T9A4 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATAD3BQ5T9A4 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATAD3BQ5T9A4 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATAD3BQ5T9A4 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATAD3BQ5T9A4 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATAD3BQ5T9A4 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATAD3BQ5T9A4 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATAD3BQ5T9A4 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATAD3BQ5T9A4 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATAD3BQ5T9A4 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATAD3BQ5T9A4 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATAD3BQ5T9A4 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATAD3BQ5T9A4 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATAD3BQ5T9A4 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATAD3BQ5T9A4 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATAD3BQ5T9A4 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATAD3BQ5T9A4 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ATAD3BQ5T9A4 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATAD3BQ5T9A4 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATAD3BQ5T9A4 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATAD3BQ5T9A4 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATAD3BQ5T9A4 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATAD3BQ5T9A4 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATAD3BQ5T9A4 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATAD3BQ5T9A4 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATAD3BQ5T9A4 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATAD3BQ5T9A4 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATAD3BQ5T9A4 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATAD3BQ5T9A4 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATAD3BQ5T9A4 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATAD3BQ5T9A4 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATAD3BQ5T9A4 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATAD3BQ5T9A4 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATAD3BQ5T9A4 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATAD3BQ5T9A4 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATAD3BQ5T9A4 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATAD3BQ5T9A4 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATAD3BQ5T9A4 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATAD3BQ5T9A4 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATAD3BQ5T9A4 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATAD3BQ5T9A4 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATAD3BQ5T9A4 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATAD3BQ5T9A4 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATAD3BQ5T9A4 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATAD3BQ5T9A4 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATAD3BQ5T9A4 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATAD3BQ5T9A4 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATAD3BQ5T9A4 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATAD3BQ5T9A4 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATAD3BQ5T9A4 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATAD3BQ5T9A4 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ATAD3BQ5T9A4 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATAD3BQ5T9A4 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATAD3BQ5T9A4 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATAD3BQ5T9A4 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ATAD3BQ5T9A4 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATAD3BQ5T9A4 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATAD3BQ5T9A4 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATAD3BQ5T9A4 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ATAD3BQ5T9A4 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATAD3BQ5T9A4 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATAD3BQ5T9A4 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATAD3BQ5T9A4 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATAD3BQ5T9A4 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATAD3BQ5T9A4 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATAD3BQ5T9A4 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATAD3BQ5T9A4 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATAD3BQ5T9A4 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATAD3BQ5T9A4 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATAD3BQ5T9A4 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATAD3BQ5T9A4 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATAD3BQ5T9A4 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATAD3BQ5T9A4 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATAD3BQ5T9A4 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATAD3BQ5T9A4 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATAD3BQ5T9A4 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATAD3BQ5T9A4 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATAD3BQ5T9A4 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATAD3BQ5T9A4 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATAD3BQ5T9A4 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATAD3BQ5T9A4 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATAD3BQ5T9A4 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATAD3BQ5T9A4 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATAD3BQ5T9A4 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATAD3BQ5T9A4 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATAD3BQ5T9A4 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATAD3BQ5T9A4 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATAD3BQ5T9A4 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ATAD3BQ5T9A4 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATAD3BQ5T9A4 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATAD3BQ5T9A4 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATAD3BQ5T9A4 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATAD3BQ5T9A4 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATAD3BQ5T9A4 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATAD3BQ5T9A4 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATAD3BQ5T9A4 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATAD3BQ5T9A4 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATAD3BQ5T9A4 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATAD3BQ5T9A4 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.6 ms