Protein–RNA interactions for Protein: Q5T700

LDLRAD1, Low-density lipoprotein receptor class A domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDLRAD1Q5T700 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LDLRAD1Q5T700 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
LDLRAD1Q5T700 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LDLRAD1Q5T700 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LDLRAD1Q5T700 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LDLRAD1Q5T700 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LDLRAD1Q5T700 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LDLRAD1Q5T700 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LDLRAD1Q5T700 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LDLRAD1Q5T700 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LDLRAD1Q5T700 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LDLRAD1Q5T700 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LDLRAD1Q5T700 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LDLRAD1Q5T700 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LDLRAD1Q5T700 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LDLRAD1Q5T700 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LDLRAD1Q5T700 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LDLRAD1Q5T700 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LDLRAD1Q5T700 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LDLRAD1Q5T700 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LDLRAD1Q5T700 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LDLRAD1Q5T700 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LDLRAD1Q5T700 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
LDLRAD1Q5T700 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LDLRAD1Q5T700 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LDLRAD1Q5T700 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LDLRAD1Q5T700 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LDLRAD1Q5T700 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
LDLRAD1Q5T700 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LDLRAD1Q5T700 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LDLRAD1Q5T700 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LDLRAD1Q5T700 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LDLRAD1Q5T700 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LDLRAD1Q5T700 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LDLRAD1Q5T700 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LDLRAD1Q5T700 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LDLRAD1Q5T700 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LDLRAD1Q5T700 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LDLRAD1Q5T700 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LDLRAD1Q5T700 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
LDLRAD1Q5T700 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LDLRAD1Q5T700 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LDLRAD1Q5T700 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LDLRAD1Q5T700 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LDLRAD1Q5T700 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LDLRAD1Q5T700 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LDLRAD1Q5T700 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LDLRAD1Q5T700 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LDLRAD1Q5T700 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LDLRAD1Q5T700 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LDLRAD1Q5T700 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LDLRAD1Q5T700 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LDLRAD1Q5T700 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LDLRAD1Q5T700 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LDLRAD1Q5T700 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LDLRAD1Q5T700 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LDLRAD1Q5T700 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
LDLRAD1Q5T700 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LDLRAD1Q5T700 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LDLRAD1Q5T700 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LDLRAD1Q5T700 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LDLRAD1Q5T700 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LDLRAD1Q5T700 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LDLRAD1Q5T700 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LDLRAD1Q5T700 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
LDLRAD1Q5T700 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LDLRAD1Q5T700 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LDLRAD1Q5T700 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LDLRAD1Q5T700 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LDLRAD1Q5T700 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LDLRAD1Q5T700 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LDLRAD1Q5T700 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LDLRAD1Q5T700 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LDLRAD1Q5T700 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LDLRAD1Q5T700 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LDLRAD1Q5T700 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LDLRAD1Q5T700 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LDLRAD1Q5T700 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LDLRAD1Q5T700 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LDLRAD1Q5T700 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LDLRAD1Q5T700 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LDLRAD1Q5T700 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LDLRAD1Q5T700 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
LDLRAD1Q5T700 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LDLRAD1Q5T700 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LDLRAD1Q5T700 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LDLRAD1Q5T700 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LDLRAD1Q5T700 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LDLRAD1Q5T700 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LDLRAD1Q5T700 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LDLRAD1Q5T700 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LDLRAD1Q5T700 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LDLRAD1Q5T700 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LDLRAD1Q5T700 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LDLRAD1Q5T700 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LDLRAD1Q5T700 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LDLRAD1Q5T700 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LDLRAD1Q5T700 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LDLRAD1Q5T700 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LDLRAD1Q5T700 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms