Protein–RNA interactions for Protein: Q5PRF9

SAMD4B, Protein Smaug homolog 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD4BQ5PRF9 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SAMD4BQ5PRF9 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SAMD4BQ5PRF9 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SAMD4BQ5PRF9 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SAMD4BQ5PRF9 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SAMD4BQ5PRF9 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SAMD4BQ5PRF9 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SAMD4BQ5PRF9 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SAMD4BQ5PRF9 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SAMD4BQ5PRF9 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SAMD4BQ5PRF9 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SAMD4BQ5PRF9 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SAMD4BQ5PRF9 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SAMD4BQ5PRF9 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SAMD4BQ5PRF9 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SAMD4BQ5PRF9 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SAMD4BQ5PRF9 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SAMD4BQ5PRF9 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SAMD4BQ5PRF9 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SAMD4BQ5PRF9 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SAMD4BQ5PRF9 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SAMD4BQ5PRF9 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SAMD4BQ5PRF9 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SAMD4BQ5PRF9 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SAMD4BQ5PRF9 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SAMD4BQ5PRF9 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SAMD4BQ5PRF9 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SAMD4BQ5PRF9 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SAMD4BQ5PRF9 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SAMD4BQ5PRF9 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SAMD4BQ5PRF9 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SAMD4BQ5PRF9 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SAMD4BQ5PRF9 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SAMD4BQ5PRF9 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SAMD4BQ5PRF9 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SAMD4BQ5PRF9 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SAMD4BQ5PRF9 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SAMD4BQ5PRF9 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SAMD4BQ5PRF9 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SAMD4BQ5PRF9 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SAMD4BQ5PRF9 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SAMD4BQ5PRF9 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SAMD4BQ5PRF9 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SAMD4BQ5PRF9 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SAMD4BQ5PRF9 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SAMD4BQ5PRF9 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SAMD4BQ5PRF9 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SAMD4BQ5PRF9 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SAMD4BQ5PRF9 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SAMD4BQ5PRF9 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SAMD4BQ5PRF9 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SAMD4BQ5PRF9 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SAMD4BQ5PRF9 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SAMD4BQ5PRF9 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SAMD4BQ5PRF9 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SAMD4BQ5PRF9 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SAMD4BQ5PRF9 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SAMD4BQ5PRF9 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SAMD4BQ5PRF9 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SAMD4BQ5PRF9 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SAMD4BQ5PRF9 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SAMD4BQ5PRF9 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SAMD4BQ5PRF9 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SAMD4BQ5PRF9 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SAMD4BQ5PRF9 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SAMD4BQ5PRF9 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SAMD4BQ5PRF9 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SAMD4BQ5PRF9 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SAMD4BQ5PRF9 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SAMD4BQ5PRF9 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SAMD4BQ5PRF9 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SAMD4BQ5PRF9 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SAMD4BQ5PRF9 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SAMD4BQ5PRF9 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SAMD4BQ5PRF9 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SAMD4BQ5PRF9 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SAMD4BQ5PRF9 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SAMD4BQ5PRF9 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SAMD4BQ5PRF9 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SAMD4BQ5PRF9 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SAMD4BQ5PRF9 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SAMD4BQ5PRF9 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SAMD4BQ5PRF9 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SAMD4BQ5PRF9 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SAMD4BQ5PRF9 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SAMD4BQ5PRF9 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SAMD4BQ5PRF9 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SAMD4BQ5PRF9 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SAMD4BQ5PRF9 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SAMD4BQ5PRF9 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SAMD4BQ5PRF9 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SAMD4BQ5PRF9 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SAMD4BQ5PRF9 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SAMD4BQ5PRF9 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SAMD4BQ5PRF9 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SAMD4BQ5PRF9 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SAMD4BQ5PRF9 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SAMD4BQ5PRF9 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SAMD4BQ5PRF9 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SAMD4BQ5PRF9 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms