Protein–RNA interactions for Protein: Q5GLZ8

HERC4, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,057 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC4Q5GLZ8 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HERC4Q5GLZ8 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HERC4Q5GLZ8 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HERC4Q5GLZ8 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HERC4Q5GLZ8 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HERC4Q5GLZ8 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HERC4Q5GLZ8 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HERC4Q5GLZ8 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HERC4Q5GLZ8 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HERC4Q5GLZ8 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HERC4Q5GLZ8 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HERC4Q5GLZ8 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HERC4Q5GLZ8 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HERC4Q5GLZ8 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HERC4Q5GLZ8 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HERC4Q5GLZ8 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HERC4Q5GLZ8 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
HERC4Q5GLZ8 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HERC4Q5GLZ8 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HERC4Q5GLZ8 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HERC4Q5GLZ8 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HERC4Q5GLZ8 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HERC4Q5GLZ8 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HERC4Q5GLZ8 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HERC4Q5GLZ8 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HERC4Q5GLZ8 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HERC4Q5GLZ8 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
HERC4Q5GLZ8 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HERC4Q5GLZ8 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
HERC4Q5GLZ8 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
HERC4Q5GLZ8 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HERC4Q5GLZ8 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HERC4Q5GLZ8 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HERC4Q5GLZ8 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HERC4Q5GLZ8 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HERC4Q5GLZ8 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
HERC4Q5GLZ8 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HERC4Q5GLZ8 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HERC4Q5GLZ8 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HERC4Q5GLZ8 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HERC4Q5GLZ8 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HERC4Q5GLZ8 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HERC4Q5GLZ8 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HERC4Q5GLZ8 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HERC4Q5GLZ8 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HERC4Q5GLZ8 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HERC4Q5GLZ8 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HERC4Q5GLZ8 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
HERC4Q5GLZ8 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HERC4Q5GLZ8 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HERC4Q5GLZ8 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HERC4Q5GLZ8 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
HERC4Q5GLZ8 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
HERC4Q5GLZ8 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
HERC4Q5GLZ8 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
HERC4Q5GLZ8 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
HERC4Q5GLZ8 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
HERC4Q5GLZ8 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
HERC4Q5GLZ8 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
HERC4Q5GLZ8 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
HERC4Q5GLZ8 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
HERC4Q5GLZ8 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HERC4Q5GLZ8 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HERC4Q5GLZ8 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
HERC4Q5GLZ8 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
HERC4Q5GLZ8 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HERC4Q5GLZ8 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
HERC4Q5GLZ8 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
HERC4Q5GLZ8 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
HERC4Q5GLZ8 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC21.32■■□□□ 1
HERC4Q5GLZ8 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
HERC4Q5GLZ8 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
HERC4Q5GLZ8 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
HERC4Q5GLZ8 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
HERC4Q5GLZ8 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HERC4Q5GLZ8 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
HERC4Q5GLZ8 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
HERC4Q5GLZ8 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HERC4Q5GLZ8 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HERC4Q5GLZ8 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HERC4Q5GLZ8 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HERC4Q5GLZ8 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HERC4Q5GLZ8 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HERC4Q5GLZ8 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
HERC4Q5GLZ8 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HERC4Q5GLZ8 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HERC4Q5GLZ8 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HERC4Q5GLZ8 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HERC4Q5GLZ8 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
HERC4Q5GLZ8 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
HERC4Q5GLZ8 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HERC4Q5GLZ8 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
HERC4Q5GLZ8 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
HERC4Q5GLZ8 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HERC4Q5GLZ8 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
HERC4Q5GLZ8 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC21.31■■□□□ 1
HERC4Q5GLZ8 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
HERC4Q5GLZ8 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC21.31■■□□□ 1
HERC4Q5GLZ8 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
HERC4Q5GLZ8 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
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