Protein–RNA interactions for Protein: Q53GG5

PDLIM3, PDZ and LIM domain protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDLIM3Q53GG5 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PDLIM3Q53GG5 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PDLIM3Q53GG5 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PDLIM3Q53GG5 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PDLIM3Q53GG5 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PDLIM3Q53GG5 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PDLIM3Q53GG5 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PDLIM3Q53GG5 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PDLIM3Q53GG5 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PDLIM3Q53GG5 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PDLIM3Q53GG5 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PDLIM3Q53GG5 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PDLIM3Q53GG5 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PDLIM3Q53GG5 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PDLIM3Q53GG5 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PDLIM3Q53GG5 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PDLIM3Q53GG5 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PDLIM3Q53GG5 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PDLIM3Q53GG5 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PDLIM3Q53GG5 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PDLIM3Q53GG5 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PDLIM3Q53GG5 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PDLIM3Q53GG5 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PDLIM3Q53GG5 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PDLIM3Q53GG5 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PDLIM3Q53GG5 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PDLIM3Q53GG5 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PDLIM3Q53GG5 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PDLIM3Q53GG5 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PDLIM3Q53GG5 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PDLIM3Q53GG5 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PDLIM3Q53GG5 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PDLIM3Q53GG5 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PDLIM3Q53GG5 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PDLIM3Q53GG5 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PDLIM3Q53GG5 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PDLIM3Q53GG5 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PDLIM3Q53GG5 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PDLIM3Q53GG5 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PDLIM3Q53GG5 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PDLIM3Q53GG5 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PDLIM3Q53GG5 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
PDLIM3Q53GG5 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PDLIM3Q53GG5 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
PDLIM3Q53GG5 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
PDLIM3Q53GG5 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PDLIM3Q53GG5 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PDLIM3Q53GG5 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PDLIM3Q53GG5 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PDLIM3Q53GG5 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PDLIM3Q53GG5 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PDLIM3Q53GG5 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PDLIM3Q53GG5 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PDLIM3Q53GG5 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PDLIM3Q53GG5 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PDLIM3Q53GG5 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PDLIM3Q53GG5 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PDLIM3Q53GG5 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PDLIM3Q53GG5 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PDLIM3Q53GG5 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PDLIM3Q53GG5 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PDLIM3Q53GG5 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PDLIM3Q53GG5 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PDLIM3Q53GG5 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PDLIM3Q53GG5 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PDLIM3Q53GG5 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PDLIM3Q53GG5 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PDLIM3Q53GG5 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PDLIM3Q53GG5 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PDLIM3Q53GG5 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PDLIM3Q53GG5 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PDLIM3Q53GG5 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PDLIM3Q53GG5 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PDLIM3Q53GG5 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PDLIM3Q53GG5 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PDLIM3Q53GG5 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PDLIM3Q53GG5 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PDLIM3Q53GG5 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PDLIM3Q53GG5 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PDLIM3Q53GG5 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PDLIM3Q53GG5 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PDLIM3Q53GG5 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PDLIM3Q53GG5 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
PDLIM3Q53GG5 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
PDLIM3Q53GG5 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PDLIM3Q53GG5 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PDLIM3Q53GG5 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PDLIM3Q53GG5 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PDLIM3Q53GG5 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PDLIM3Q53GG5 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PDLIM3Q53GG5 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PDLIM3Q53GG5 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PDLIM3Q53GG5 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
PDLIM3Q53GG5 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PDLIM3Q53GG5 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PDLIM3Q53GG5 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PDLIM3Q53GG5 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PDLIM3Q53GG5 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PDLIM3Q53GG5 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PDLIM3Q53GG5 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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