Protein–RNA interactions for Protein: Q52LA3

LIN52, Protein lin-52 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIN52Q52LA3 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LIN52Q52LA3 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LIN52Q52LA3 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LIN52Q52LA3 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LIN52Q52LA3 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LIN52Q52LA3 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LIN52Q52LA3 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LIN52Q52LA3 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LIN52Q52LA3 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LIN52Q52LA3 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LIN52Q52LA3 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LIN52Q52LA3 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LIN52Q52LA3 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
LIN52Q52LA3 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LIN52Q52LA3 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LIN52Q52LA3 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LIN52Q52LA3 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LIN52Q52LA3 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LIN52Q52LA3 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LIN52Q52LA3 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LIN52Q52LA3 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LIN52Q52LA3 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LIN52Q52LA3 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LIN52Q52LA3 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LIN52Q52LA3 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LIN52Q52LA3 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LIN52Q52LA3 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LIN52Q52LA3 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LIN52Q52LA3 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LIN52Q52LA3 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LIN52Q52LA3 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LIN52Q52LA3 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LIN52Q52LA3 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LIN52Q52LA3 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LIN52Q52LA3 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LIN52Q52LA3 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LIN52Q52LA3 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LIN52Q52LA3 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LIN52Q52LA3 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LIN52Q52LA3 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LIN52Q52LA3 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LIN52Q52LA3 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LIN52Q52LA3 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
LIN52Q52LA3 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
LIN52Q52LA3 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
LIN52Q52LA3 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LIN52Q52LA3 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LIN52Q52LA3 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LIN52Q52LA3 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
LIN52Q52LA3 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LIN52Q52LA3 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LIN52Q52LA3 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LIN52Q52LA3 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
LIN52Q52LA3 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LIN52Q52LA3 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LIN52Q52LA3 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LIN52Q52LA3 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LIN52Q52LA3 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LIN52Q52LA3 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LIN52Q52LA3 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LIN52Q52LA3 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LIN52Q52LA3 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LIN52Q52LA3 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LIN52Q52LA3 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LIN52Q52LA3 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LIN52Q52LA3 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LIN52Q52LA3 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LIN52Q52LA3 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LIN52Q52LA3 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LIN52Q52LA3 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LIN52Q52LA3 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LIN52Q52LA3 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
LIN52Q52LA3 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LIN52Q52LA3 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LIN52Q52LA3 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LIN52Q52LA3 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LIN52Q52LA3 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LIN52Q52LA3 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LIN52Q52LA3 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LIN52Q52LA3 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
LIN52Q52LA3 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
LIN52Q52LA3 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
LIN52Q52LA3 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.51
LIN52Q52LA3 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
LIN52Q52LA3 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
LIN52Q52LA3 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
LIN52Q52LA3 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
LIN52Q52LA3 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
LIN52Q52LA3 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
LIN52Q52LA3 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
LIN52Q52LA3 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
LIN52Q52LA3 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LIN52Q52LA3 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
LIN52Q52LA3 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LIN52Q52LA3 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LIN52Q52LA3 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LIN52Q52LA3 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LIN52Q52LA3 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LIN52Q52LA3 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LIN52Q52LA3 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms