Protein–RNA interactions for Protein: Q4KMQ1

TPRN, Taperin, humanhuman

Predictions only

Length 711 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPRNQ4KMQ1 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TPRNQ4KMQ1 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TPRNQ4KMQ1 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TPRNQ4KMQ1 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TPRNQ4KMQ1 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TPRNQ4KMQ1 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TPRNQ4KMQ1 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TPRNQ4KMQ1 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TPRNQ4KMQ1 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TPRNQ4KMQ1 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TPRNQ4KMQ1 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
TPRNQ4KMQ1 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
TPRNQ4KMQ1 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TPRNQ4KMQ1 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TPRNQ4KMQ1 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TPRNQ4KMQ1 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TPRNQ4KMQ1 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TPRNQ4KMQ1 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TPRNQ4KMQ1 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TPRNQ4KMQ1 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TPRNQ4KMQ1 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TPRNQ4KMQ1 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TPRNQ4KMQ1 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TPRNQ4KMQ1 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TPRNQ4KMQ1 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TPRNQ4KMQ1 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TPRNQ4KMQ1 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TPRNQ4KMQ1 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TPRNQ4KMQ1 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TPRNQ4KMQ1 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TPRNQ4KMQ1 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TPRNQ4KMQ1 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TPRNQ4KMQ1 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TPRNQ4KMQ1 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TPRNQ4KMQ1 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TPRNQ4KMQ1 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TPRNQ4KMQ1 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TPRNQ4KMQ1 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TPRNQ4KMQ1 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TPRNQ4KMQ1 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TPRNQ4KMQ1 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TPRNQ4KMQ1 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TPRNQ4KMQ1 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TPRNQ4KMQ1 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TPRNQ4KMQ1 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TPRNQ4KMQ1 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TPRNQ4KMQ1 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TPRNQ4KMQ1 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TPRNQ4KMQ1 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TPRNQ4KMQ1 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
TPRNQ4KMQ1 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
TPRNQ4KMQ1 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TPRNQ4KMQ1 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TPRNQ4KMQ1 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TPRNQ4KMQ1 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TPRNQ4KMQ1 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TPRNQ4KMQ1 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TPRNQ4KMQ1 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TPRNQ4KMQ1 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TPRNQ4KMQ1 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TPRNQ4KMQ1 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TPRNQ4KMQ1 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TPRNQ4KMQ1 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TPRNQ4KMQ1 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TPRNQ4KMQ1 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TPRNQ4KMQ1 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TPRNQ4KMQ1 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
TPRNQ4KMQ1 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TPRNQ4KMQ1 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TPRNQ4KMQ1 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TPRNQ4KMQ1 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TPRNQ4KMQ1 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TPRNQ4KMQ1 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TPRNQ4KMQ1 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TPRNQ4KMQ1 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TPRNQ4KMQ1 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TPRNQ4KMQ1 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TPRNQ4KMQ1 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TPRNQ4KMQ1 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TPRNQ4KMQ1 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TPRNQ4KMQ1 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TPRNQ4KMQ1 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TPRNQ4KMQ1 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TPRNQ4KMQ1 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TPRNQ4KMQ1 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TPRNQ4KMQ1 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TPRNQ4KMQ1 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TPRNQ4KMQ1 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TPRNQ4KMQ1 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TPRNQ4KMQ1 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TPRNQ4KMQ1 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TPRNQ4KMQ1 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TPRNQ4KMQ1 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TPRNQ4KMQ1 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TPRNQ4KMQ1 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TPRNQ4KMQ1 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TPRNQ4KMQ1 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TPRNQ4KMQ1 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TPRNQ4KMQ1 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TPRNQ4KMQ1 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
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