Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RTL8BQ17RB0 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RTL8BQ17RB0 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RTL8BQ17RB0 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RTL8BQ17RB0 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RTL8BQ17RB0 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RTL8BQ17RB0 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RTL8BQ17RB0 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RTL8BQ17RB0 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RTL8BQ17RB0 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
RTL8BQ17RB0 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RTL8BQ17RB0 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RTL8BQ17RB0 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RTL8BQ17RB0 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RTL8BQ17RB0 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RTL8BQ17RB0 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RTL8BQ17RB0 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RTL8BQ17RB0 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RTL8BQ17RB0 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RTL8BQ17RB0 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RTL8BQ17RB0 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RTL8BQ17RB0 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RTL8BQ17RB0 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RTL8BQ17RB0 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RTL8BQ17RB0 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RTL8BQ17RB0 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RTL8BQ17RB0 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RTL8BQ17RB0 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RTL8BQ17RB0 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RTL8BQ17RB0 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RTL8BQ17RB0 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RTL8BQ17RB0 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RTL8BQ17RB0 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RTL8BQ17RB0 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RTL8BQ17RB0 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RTL8BQ17RB0 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RTL8BQ17RB0 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RTL8BQ17RB0 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RTL8BQ17RB0 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RTL8BQ17RB0 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RTL8BQ17RB0 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RTL8BQ17RB0 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RTL8BQ17RB0 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RTL8BQ17RB0 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RTL8BQ17RB0 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
RTL8BQ17RB0 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RTL8BQ17RB0 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RTL8BQ17RB0 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RTL8BQ17RB0 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RTL8BQ17RB0 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RTL8BQ17RB0 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RTL8BQ17RB0 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RTL8BQ17RB0 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RTL8BQ17RB0 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RTL8BQ17RB0 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RTL8BQ17RB0 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RTL8BQ17RB0 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RTL8BQ17RB0 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RTL8BQ17RB0 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RTL8BQ17RB0 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RTL8BQ17RB0 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RTL8BQ17RB0 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RTL8BQ17RB0 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RTL8BQ17RB0 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RTL8BQ17RB0 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RTL8BQ17RB0 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RTL8BQ17RB0 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RTL8BQ17RB0 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RTL8BQ17RB0 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RTL8BQ17RB0 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RTL8BQ17RB0 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RTL8BQ17RB0 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RTL8BQ17RB0 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RTL8BQ17RB0 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RTL8BQ17RB0 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RTL8BQ17RB0 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RTL8BQ17RB0 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RTL8BQ17RB0 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RTL8BQ17RB0 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RTL8BQ17RB0 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RTL8BQ17RB0 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RTL8BQ17RB0 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RTL8BQ17RB0 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RTL8BQ17RB0 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RTL8BQ17RB0 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RTL8BQ17RB0 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RTL8BQ17RB0 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RTL8BQ17RB0 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RTL8BQ17RB0 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RTL8BQ17RB0 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RTL8BQ17RB0 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RTL8BQ17RB0 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RTL8BQ17RB0 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RTL8BQ17RB0 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RTL8BQ17RB0 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RTL8BQ17RB0 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RTL8BQ17RB0 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RTL8BQ17RB0 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RTL8BQ17RB0 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RTL8BQ17RB0 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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