Protein–RNA interactions for Protein: Q16864

ATP6V1F, V-type proton ATPase subunit F, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6V1FQ16864 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP6V1FQ16864 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP6V1FQ16864 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP6V1FQ16864 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP6V1FQ16864 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP6V1FQ16864 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP6V1FQ16864 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP6V1FQ16864 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP6V1FQ16864 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP6V1FQ16864 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP6V1FQ16864 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP6V1FQ16864 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP6V1FQ16864 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP6V1FQ16864 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP6V1FQ16864 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP6V1FQ16864 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP6V1FQ16864 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP6V1FQ16864 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP6V1FQ16864 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP6V1FQ16864 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP6V1FQ16864 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP6V1FQ16864 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP6V1FQ16864 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP6V1FQ16864 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP6V1FQ16864 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP6V1FQ16864 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATP6V1FQ16864 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATP6V1FQ16864 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATP6V1FQ16864 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATP6V1FQ16864 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATP6V1FQ16864 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATP6V1FQ16864 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATP6V1FQ16864 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATP6V1FQ16864 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATP6V1FQ16864 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATP6V1FQ16864 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATP6V1FQ16864 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATP6V1FQ16864 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATP6V1FQ16864 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATP6V1FQ16864 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATP6V1FQ16864 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATP6V1FQ16864 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATP6V1FQ16864 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATP6V1FQ16864 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATP6V1FQ16864 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATP6V1FQ16864 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATP6V1FQ16864 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATP6V1FQ16864 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATP6V1FQ16864 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATP6V1FQ16864 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATP6V1FQ16864 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATP6V1FQ16864 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ATP6V1FQ16864 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATP6V1FQ16864 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ATP6V1FQ16864 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATP6V1FQ16864 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATP6V1FQ16864 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATP6V1FQ16864 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATP6V1FQ16864 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATP6V1FQ16864 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATP6V1FQ16864 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATP6V1FQ16864 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATP6V1FQ16864 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATP6V1FQ16864 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATP6V1FQ16864 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATP6V1FQ16864 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATP6V1FQ16864 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATP6V1FQ16864 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
ATP6V1FQ16864 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATP6V1FQ16864 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATP6V1FQ16864 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
ATP6V1FQ16864 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATP6V1FQ16864 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATP6V1FQ16864 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
ATP6V1FQ16864 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATP6V1FQ16864 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATP6V1FQ16864 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATP6V1FQ16864 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATP6V1FQ16864 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ATP6V1FQ16864 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ATP6V1FQ16864 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ATP6V1FQ16864 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ATP6V1FQ16864 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ATP6V1FQ16864 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ATP6V1FQ16864 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ATP6V1FQ16864 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ATP6V1FQ16864 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ATP6V1FQ16864 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ATP6V1FQ16864 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ATP6V1FQ16864 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ATP6V1FQ16864 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ATP6V1FQ16864 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ATP6V1FQ16864 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ATP6V1FQ16864 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ATP6V1FQ16864 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ATP6V1FQ16864 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP6V1FQ16864 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP6V1FQ16864 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP6V1FQ16864 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP6V1FQ16864 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
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