Protein–RNA interactions for Protein: Q16621

NFE2, Transcription factor NF-E2 45 kDa subunit, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 373 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFE2Q16621 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NFE2Q16621 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NFE2Q16621 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NFE2Q16621 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NFE2Q16621 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NFE2Q16621 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NFE2Q16621 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NFE2Q16621 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NFE2Q16621 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NFE2Q16621 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NFE2Q16621 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NFE2Q16621 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NFE2Q16621 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NFE2Q16621 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NFE2Q16621 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NFE2Q16621 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NFE2Q16621 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NFE2Q16621 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
NFE2Q16621 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
NFE2Q16621 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
NFE2Q16621 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NFE2Q16621 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NFE2Q16621 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NFE2Q16621 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NFE2Q16621 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NFE2Q16621 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
NFE2Q16621 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NFE2Q16621 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NFE2Q16621 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NFE2Q16621 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NFE2Q16621 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NFE2Q16621 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NFE2Q16621 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NFE2Q16621 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NFE2Q16621 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NFE2Q16621 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NFE2Q16621 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NFE2Q16621 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NFE2Q16621 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NFE2Q16621 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NFE2Q16621 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NFE2Q16621 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NFE2Q16621 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NFE2Q16621 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NFE2Q16621 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NFE2Q16621 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NFE2Q16621 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NFE2Q16621 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NFE2Q16621 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NFE2Q16621 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NFE2Q16621 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NFE2Q16621 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NFE2Q16621 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NFE2Q16621 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NFE2Q16621 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NFE2Q16621 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NFE2Q16621 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NFE2Q16621 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NFE2Q16621 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NFE2Q16621 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NFE2Q16621 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NFE2Q16621 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NFE2Q16621 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NFE2Q16621 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NFE2Q16621 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NFE2Q16621 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NFE2Q16621 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
NFE2Q16621 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NFE2Q16621 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NFE2Q16621 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NFE2Q16621 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NFE2Q16621 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NFE2Q16621 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NFE2Q16621 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NFE2Q16621 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NFE2Q16621 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NFE2Q16621 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NFE2Q16621 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NFE2Q16621 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NFE2Q16621 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NFE2Q16621 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NFE2Q16621 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NFE2Q16621 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NFE2Q16621 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NFE2Q16621 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NFE2Q16621 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NFE2Q16621 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
NFE2Q16621 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NFE2Q16621 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NFE2Q16621 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NFE2Q16621 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NFE2Q16621 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NFE2Q16621 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NFE2Q16621 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
NFE2Q16621 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
NFE2Q16621 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NFE2Q16621 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NFE2Q16621 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NFE2Q16621 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NFE2Q16621 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms