Protein–RNA interactions for Protein: Q16281

CNGA3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3Q16281 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
CNGA3Q16281 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CNGA3Q16281 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
CNGA3Q16281 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CNGA3Q16281 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CNGA3Q16281 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CNGA3Q16281 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
CNGA3Q16281 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
CNGA3Q16281 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
CNGA3Q16281 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CNGA3Q16281 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CNGA3Q16281 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CNGA3Q16281 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CNGA3Q16281 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CNGA3Q16281 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CNGA3Q16281 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CNGA3Q16281 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CNGA3Q16281 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CNGA3Q16281 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CNGA3Q16281 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CNGA3Q16281 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CNGA3Q16281 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CNGA3Q16281 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CNGA3Q16281 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CNGA3Q16281 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CNGA3Q16281 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CNGA3Q16281 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CNGA3Q16281 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CNGA3Q16281 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CNGA3Q16281 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CNGA3Q16281 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CNGA3Q16281 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CNGA3Q16281 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CNGA3Q16281 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CNGA3Q16281 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CNGA3Q16281 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CNGA3Q16281 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CNGA3Q16281 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CNGA3Q16281 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CNGA3Q16281 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CNGA3Q16281 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
CNGA3Q16281 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CNGA3Q16281 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CNGA3Q16281 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CNGA3Q16281 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CNGA3Q16281 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
CNGA3Q16281 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
CNGA3Q16281 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CNGA3Q16281 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CNGA3Q16281 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CNGA3Q16281 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CNGA3Q16281 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CNGA3Q16281 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CNGA3Q16281 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CNGA3Q16281 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CNGA3Q16281 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CNGA3Q16281 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CNGA3Q16281 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CNGA3Q16281 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CNGA3Q16281 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CNGA3Q16281 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CNGA3Q16281 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CNGA3Q16281 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CNGA3Q16281 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CNGA3Q16281 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CNGA3Q16281 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CNGA3Q16281 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CNGA3Q16281 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CNGA3Q16281 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CNGA3Q16281 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CNGA3Q16281 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CNGA3Q16281 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CNGA3Q16281 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CNGA3Q16281 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CNGA3Q16281 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CNGA3Q16281 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CNGA3Q16281 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CNGA3Q16281 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CNGA3Q16281 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CNGA3Q16281 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CNGA3Q16281 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CNGA3Q16281 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CNGA3Q16281 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CNGA3Q16281 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CNGA3Q16281 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CNGA3Q16281 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CNGA3Q16281 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CNGA3Q16281 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CNGA3Q16281 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CNGA3Q16281 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CNGA3Q16281 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CNGA3Q16281 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CNGA3Q16281 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CNGA3Q16281 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CNGA3Q16281 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CNGA3Q16281 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CNGA3Q16281 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CNGA3Q16281 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
CNGA3Q16281 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CNGA3Q16281 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
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