Protein–RNA interactions for Protein: Q15645

TRIP13, Pachytene checkpoint protein 2 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP13Q15645 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TRIP13Q15645 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TRIP13Q15645 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TRIP13Q15645 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TRIP13Q15645 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TRIP13Q15645 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TRIP13Q15645 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TRIP13Q15645 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TRIP13Q15645 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
TRIP13Q15645 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TRIP13Q15645 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TRIP13Q15645 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TRIP13Q15645 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TRIP13Q15645 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TRIP13Q15645 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TRIP13Q15645 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TRIP13Q15645 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TRIP13Q15645 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TRIP13Q15645 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
TRIP13Q15645 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TRIP13Q15645 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
TRIP13Q15645 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TRIP13Q15645 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TRIP13Q15645 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
TRIP13Q15645 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TRIP13Q15645 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TRIP13Q15645 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TRIP13Q15645 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TRIP13Q15645 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TRIP13Q15645 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TRIP13Q15645 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TRIP13Q15645 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TRIP13Q15645 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TRIP13Q15645 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TRIP13Q15645 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
TRIP13Q15645 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
TRIP13Q15645 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TRIP13Q15645 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TRIP13Q15645 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
TRIP13Q15645 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
TRIP13Q15645 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
TRIP13Q15645 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TRIP13Q15645 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
TRIP13Q15645 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
TRIP13Q15645 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
TRIP13Q15645 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
TRIP13Q15645 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TRIP13Q15645 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC19.77■□□□□ 0.76
TRIP13Q15645 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
TRIP13Q15645 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
TRIP13Q15645 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
TRIP13Q15645 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TRIP13Q15645 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TRIP13Q15645 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TRIP13Q15645 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TRIP13Q15645 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.75
TRIP13Q15645 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TRIP13Q15645 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TRIP13Q15645 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TRIP13Q15645 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TRIP13Q15645 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TRIP13Q15645 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TRIP13Q15645 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TRIP13Q15645 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TRIP13Q15645 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TRIP13Q15645 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TRIP13Q15645 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TRIP13Q15645 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TRIP13Q15645 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TRIP13Q15645 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TRIP13Q15645 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TRIP13Q15645 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TRIP13Q15645 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TRIP13Q15645 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TRIP13Q15645 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TRIP13Q15645 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TRIP13Q15645 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TRIP13Q15645 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TRIP13Q15645 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TRIP13Q15645 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TRIP13Q15645 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TRIP13Q15645 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TRIP13Q15645 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TRIP13Q15645 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
TRIP13Q15645 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TRIP13Q15645 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TRIP13Q15645 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TRIP13Q15645 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TRIP13Q15645 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
TRIP13Q15645 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TRIP13Q15645 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TRIP13Q15645 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TRIP13Q15645 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TRIP13Q15645 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TRIP13Q15645 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TRIP13Q15645 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TRIP13Q15645 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TRIP13Q15645 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TRIP13Q15645 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TRIP13Q15645 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms