Protein–RNA interactions for Protein: Q14683

SMC1A, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC1AQ14683 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
SMC1AQ14683 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SMC1AQ14683 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
SMC1AQ14683 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SMC1AQ14683 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SMC1AQ14683 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SMC1AQ14683 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SMC1AQ14683 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SMC1AQ14683 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SMC1AQ14683 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
SMC1AQ14683 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SMC1AQ14683 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SMC1AQ14683 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
SMC1AQ14683 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■□□□□ 0.99
SMC1AQ14683 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SMC1AQ14683 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMC1AQ14683 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMC1AQ14683 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMC1AQ14683 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMC1AQ14683 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMC1AQ14683 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMC1AQ14683 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMC1AQ14683 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMC1AQ14683 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMC1AQ14683 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMC1AQ14683 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMC1AQ14683 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMC1AQ14683 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMC1AQ14683 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMC1AQ14683 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SMC1AQ14683 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SMC1AQ14683 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SMC1AQ14683 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SMC1AQ14683 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMC1AQ14683 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMC1AQ14683 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMC1AQ14683 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMC1AQ14683 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMC1AQ14683 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMC1AQ14683 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMC1AQ14683 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMC1AQ14683 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMC1AQ14683 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMC1AQ14683 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SMC1AQ14683 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SMC1AQ14683 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SMC1AQ14683 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SMC1AQ14683 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SMC1AQ14683 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SMC1AQ14683 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SMC1AQ14683 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SMC1AQ14683 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SMC1AQ14683 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SMC1AQ14683 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SMC1AQ14683 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SMC1AQ14683 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SMC1AQ14683 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
SMC1AQ14683 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SMC1AQ14683 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SMC1AQ14683 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMC1AQ14683 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMC1AQ14683 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMC1AQ14683 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMC1AQ14683 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMC1AQ14683 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMC1AQ14683 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SMC1AQ14683 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMC1AQ14683 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMC1AQ14683 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMC1AQ14683 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMC1AQ14683 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMC1AQ14683 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SMC1AQ14683 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMC1AQ14683 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMC1AQ14683 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SMC1AQ14683 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMC1AQ14683 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMC1AQ14683 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMC1AQ14683 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMC1AQ14683 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMC1AQ14683 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMC1AQ14683 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMC1AQ14683 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMC1AQ14683 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMC1AQ14683 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMC1AQ14683 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMC1AQ14683 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMC1AQ14683 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMC1AQ14683 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMC1AQ14683 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMC1AQ14683 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMC1AQ14683 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMC1AQ14683 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMC1AQ14683 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
SMC1AQ14683 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMC1AQ14683 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMC1AQ14683 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMC1AQ14683 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMC1AQ14683 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMC1AQ14683 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
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