Protein–RNA interactions for Protein: Q14671

PUM1, Pumilio homolog 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM1Q14671 LDHA-204ENST00000396222 1766 ntTSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.293e-25■□□□□ 9.9
PUM1Q14671 LDHA-206ENST00000430553 1310 ntTSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.323e-25■□□□□ 9.9
PUM1Q14671 LDHA-221ENST00000543445 576 ntTSL 36.29□□□□□ -1.43e-25■□□□□ 9.9
PUM1Q14671 PFKL-205ENST00000466134 5986 ntTSL 219.84■□□□□ 0.773e-6■□□□□ 9.9
PUM1Q14671 PFKL-207ENST00000474114 6007 ntTSL 1 (best)18■□□□□ 0.473e-6■□□□□ 9.9
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PUM1Q14671 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.155e-10■□□□□ 9.9
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PUM1Q14671 KPNA2-201ENST00000330459 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.955e-10■□□□□ 9.9
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PUM1Q14671 URI1-204ENST00000570704 559 ntTSL 45.07□□□□□ -1.65e-10■□□□□ 9.9
PUM1Q14671 URI1-212ENST00000576442 578 ntTSL 44.93□□□□□ -1.625e-10■□□□□ 9.9
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PUM1Q14671 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.082e-11■□□□□ 9.9
PUM1Q14671 LMNA-206ENST00000368300 3190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.542e-11■□□□□ 9.9
PUM1Q14671 PHIP-201ENST00000275034 10460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.051e-7■□□□□ 9.9
PUM1Q14671 PHIP-202ENST00000479165 5694 ntTSL 1 (best)2.29□□□□□ -2.041e-7■□□□□ 9.9
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PUM1Q14671 SUPT5H-206ENST00000594729 364 ntTSL 513.14□□□□□ -0.315e-23■□□□□ 9.9
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PUM1Q14671 NMT1-207ENST00000588455 585 ntTSL 212.18□□□□□ -0.464e-16■□□□□ 9.9
PUM1Q14671 NMT1-213ENST00000592782 4999 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.554e-16■□□□□ 9.9
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PUM1Q14671 ZFC3H1-201ENST00000378743 7285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.471e-7■□□□□ 9.8
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PUM1Q14671 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.012e-8■□□□□ 9.8
PUM1Q14671 STK24-207ENST00000491878 547 ntTSL 415.08■□□□□ 02e-8■□□□□ 9.8
PUM1Q14671 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.032e-8■□□□□ 9.8
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PUM1Q14671 POLR3D-203ENST00000517789 841 ntTSL 511.9□□□□□ -0.52e-8■□□□□ 9.8
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PUM1Q14671 XPO1-203ENST00000406957 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.12e-8■□□□□ 9.8
PUM1Q14671 XPO1-202ENST00000404992 4105 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.362e-8■□□□□ 9.8
PUM1Q14671 XPO1-216ENST00000469337 568 ntTSL 45.11□□□□□ -1.592e-8■□□□□ 9.8
PUM1Q14671 RBM28-207ENST00000488249 570 ntTSL 34.22□□□□□ -1.731e-9■□□□□ 9.8
PUM1Q14671 XPO1-219ENST00000481073 3706 ntTSL 23.36□□□□□ -1.872e-8■□□□□ 9.8
PUM1Q14671 PRAME-209ENST00000439106 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 314.43□□□□□ -0.15e-12■□□□□ 9.8
PUM1Q14671 MYL12A-209ENST00000580887 899 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.151e-6■□□□□ 9.8
PUM1Q14671 MYL12A-202ENST00000536605 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.151e-6■□□□□ 9.8
PUM1Q14671 MYL12A-205ENST00000578562 623 ntTSL 34.81□□□□□ -1.641e-6■□□□□ 9.8
PUM1Q14671 SRSF11-214ENST00000484162 4008 ntTSL 1 (best)6.21□□□□□ -1.421e-6■□□□□ 9.8
PUM1Q14671 SRSF11-201ENST00000370949 3034 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.611e-6■□□□□ 9.8
PUM1Q14671 CALM2-208ENST00000489742 522 ntTSL 316.53■□□□□ 0.246e-7■□□□□ 9.8
PUM1Q14671 DDX27-204ENST00000484427 4929 ntTSL 1 (best)12.85□□□□□ -0.355e-7■□□□□ 9.8
PUM1Q14671 DDX27-206ENST00000618172 2567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.65e-7■□□□□ 9.8
PUM1Q14671 DDX27-201ENST00000371764 2643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.665e-7■□□□□ 9.8
PUM1Q14671 DDX27-207ENST00000622530 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.765e-7■□□□□ 9.8
PUM1Q14671 CHD8-210ENST00000555962 1232 ntTSL 58.84□□□□□ -0.992e-6■□□□□ 9.8
PUM1Q14671 CHD8-201ENST00000399982 8229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.092e-6■□□□□ 9.8
PUM1Q14671 CHD8-213ENST00000557364 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.14□□□□□ -1.112e-6■□□□□ 9.8
PUM1Q14671 CHD8-202ENST00000430710 7420 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.452e-6■□□□□ 9.8
PUM1Q14671 DDX46-202ENST00000452510 5689 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.812e-6■□□□□ 9.8
PUM1Q14671 DDX46-207ENST00000507392 3565 ntTSL 27.92□□□□□ -1.142e-6■□□□□ 9.8
PUM1Q14671 DDX46-201ENST00000354283 3821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.262e-6■□□□□ 9.8
PUM1Q14671 DDX46-203ENST00000503946 4078 ntTSL 24.23□□□□□ -1.732e-6■□□□□ 9.8
PUM1Q14671 RBM33-209ENST00000440108 1027 ntTSL 518.27■□□□□ 0.522e-8■□□□□ 9.8
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