Protein–RNA interactions for Protein: Q14011

CIRBP, Cold-inducible RNA-binding protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 172 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIRBPQ14011 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CIRBPQ14011 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CIRBPQ14011 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CIRBPQ14011 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CIRBPQ14011 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CIRBPQ14011 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CIRBPQ14011 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CIRBPQ14011 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CIRBPQ14011 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
CIRBPQ14011 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CIRBPQ14011 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CIRBPQ14011 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CIRBPQ14011 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CIRBPQ14011 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CIRBPQ14011 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CIRBPQ14011 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CIRBPQ14011 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CIRBPQ14011 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CIRBPQ14011 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CIRBPQ14011 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CIRBPQ14011 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CIRBPQ14011 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CIRBPQ14011 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
CIRBPQ14011 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CIRBPQ14011 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CIRBPQ14011 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CIRBPQ14011 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CIRBPQ14011 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CIRBPQ14011 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CIRBPQ14011 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CIRBPQ14011 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CIRBPQ14011 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CIRBPQ14011 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CIRBPQ14011 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CIRBPQ14011 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CIRBPQ14011 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CIRBPQ14011 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CIRBPQ14011 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CIRBPQ14011 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CIRBPQ14011 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CIRBPQ14011 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
CIRBPQ14011 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CIRBPQ14011 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CIRBPQ14011 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CIRBPQ14011 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CIRBPQ14011 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
CIRBPQ14011 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CIRBPQ14011 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CIRBPQ14011 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CIRBPQ14011 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CIRBPQ14011 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CIRBPQ14011 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CIRBPQ14011 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CIRBPQ14011 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CIRBPQ14011 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CIRBPQ14011 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CIRBPQ14011 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CIRBPQ14011 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CIRBPQ14011 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CIRBPQ14011 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CIRBPQ14011 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CIRBPQ14011 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CIRBPQ14011 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CIRBPQ14011 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CIRBPQ14011 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CIRBPQ14011 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CIRBPQ14011 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CIRBPQ14011 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CIRBPQ14011 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CIRBPQ14011 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CIRBPQ14011 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CIRBPQ14011 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CIRBPQ14011 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CIRBPQ14011 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CIRBPQ14011 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CIRBPQ14011 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CIRBPQ14011 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CIRBPQ14011 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CIRBPQ14011 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CIRBPQ14011 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CIRBPQ14011 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CIRBPQ14011 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CIRBPQ14011 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CIRBPQ14011 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CIRBPQ14011 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CIRBPQ14011 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
CIRBPQ14011 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CIRBPQ14011 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CIRBPQ14011 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CIRBPQ14011 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CIRBPQ14011 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CIRBPQ14011 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CIRBPQ14011 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CIRBPQ14011 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CIRBPQ14011 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CIRBPQ14011 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CIRBPQ14011 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CIRBPQ14011 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CIRBPQ14011 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CIRBPQ14011 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
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