Protein–RNA interactions for Protein: Q13936

CACNA1C, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, humanhuman

Predictions only

Length 2,221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1CQ13936 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CACNA1CQ13936 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CACNA1CQ13936 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CACNA1CQ13936 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CACNA1CQ13936 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CACNA1CQ13936 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CACNA1CQ13936 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CACNA1CQ13936 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CACNA1CQ13936 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CACNA1CQ13936 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CACNA1CQ13936 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CACNA1CQ13936 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CACNA1CQ13936 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CACNA1CQ13936 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CACNA1CQ13936 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CACNA1CQ13936 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CACNA1CQ13936 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CACNA1CQ13936 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CACNA1CQ13936 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CACNA1CQ13936 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
CACNA1CQ13936 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CACNA1CQ13936 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CACNA1CQ13936 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CACNA1CQ13936 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
CACNA1CQ13936 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CACNA1CQ13936 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CACNA1CQ13936 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CACNA1CQ13936 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CACNA1CQ13936 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CACNA1CQ13936 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CACNA1CQ13936 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CACNA1CQ13936 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CACNA1CQ13936 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CACNA1CQ13936 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CACNA1CQ13936 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CACNA1CQ13936 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CACNA1CQ13936 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CACNA1CQ13936 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CACNA1CQ13936 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CACNA1CQ13936 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CACNA1CQ13936 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CACNA1CQ13936 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CACNA1CQ13936 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CACNA1CQ13936 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CACNA1CQ13936 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CACNA1CQ13936 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CACNA1CQ13936 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CACNA1CQ13936 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CACNA1CQ13936 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CACNA1CQ13936 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CACNA1CQ13936 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CACNA1CQ13936 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CACNA1CQ13936 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CACNA1CQ13936 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CACNA1CQ13936 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CACNA1CQ13936 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CACNA1CQ13936 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CACNA1CQ13936 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CACNA1CQ13936 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CACNA1CQ13936 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CACNA1CQ13936 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CACNA1CQ13936 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CACNA1CQ13936 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CACNA1CQ13936 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CACNA1CQ13936 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CACNA1CQ13936 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CACNA1CQ13936 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CACNA1CQ13936 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CACNA1CQ13936 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CACNA1CQ13936 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CACNA1CQ13936 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CACNA1CQ13936 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CACNA1CQ13936 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CACNA1CQ13936 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CACNA1CQ13936 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CACNA1CQ13936 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CACNA1CQ13936 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CACNA1CQ13936 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CACNA1CQ13936 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CACNA1CQ13936 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CACNA1CQ13936 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CACNA1CQ13936 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CACNA1CQ13936 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CACNA1CQ13936 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CACNA1CQ13936 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CACNA1CQ13936 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CACNA1CQ13936 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CACNA1CQ13936 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CACNA1CQ13936 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CACNA1CQ13936 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CACNA1CQ13936 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CACNA1CQ13936 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CACNA1CQ13936 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CACNA1CQ13936 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CACNA1CQ13936 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CACNA1CQ13936 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CACNA1CQ13936 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CACNA1CQ13936 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CACNA1CQ13936 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CACNA1CQ13936 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
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