Protein–RNA interactions for Protein: Q13888

GTF2H2, General transcription factor IIH subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H2Q13888 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GTF2H2Q13888 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GTF2H2Q13888 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GTF2H2Q13888 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GTF2H2Q13888 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GTF2H2Q13888 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GTF2H2Q13888 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GTF2H2Q13888 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GTF2H2Q13888 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GTF2H2Q13888 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GTF2H2Q13888 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GTF2H2Q13888 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GTF2H2Q13888 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GTF2H2Q13888 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GTF2H2Q13888 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GTF2H2Q13888 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GTF2H2Q13888 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GTF2H2Q13888 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GTF2H2Q13888 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GTF2H2Q13888 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GTF2H2Q13888 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GTF2H2Q13888 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GTF2H2Q13888 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GTF2H2Q13888 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GTF2H2Q13888 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GTF2H2Q13888 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GTF2H2Q13888 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GTF2H2Q13888 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GTF2H2Q13888 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GTF2H2Q13888 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GTF2H2Q13888 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GTF2H2Q13888 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GTF2H2Q13888 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GTF2H2Q13888 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GTF2H2Q13888 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GTF2H2Q13888 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
GTF2H2Q13888 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GTF2H2Q13888 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GTF2H2Q13888 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GTF2H2Q13888 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GTF2H2Q13888 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GTF2H2Q13888 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GTF2H2Q13888 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GTF2H2Q13888 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GTF2H2Q13888 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GTF2H2Q13888 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GTF2H2Q13888 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GTF2H2Q13888 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GTF2H2Q13888 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GTF2H2Q13888 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GTF2H2Q13888 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GTF2H2Q13888 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GTF2H2Q13888 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GTF2H2Q13888 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GTF2H2Q13888 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GTF2H2Q13888 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GTF2H2Q13888 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GTF2H2Q13888 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GTF2H2Q13888 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GTF2H2Q13888 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GTF2H2Q13888 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GTF2H2Q13888 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GTF2H2Q13888 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
GTF2H2Q13888 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GTF2H2Q13888 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GTF2H2Q13888 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GTF2H2Q13888 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GTF2H2Q13888 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GTF2H2Q13888 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GTF2H2Q13888 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GTF2H2Q13888 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GTF2H2Q13888 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GTF2H2Q13888 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GTF2H2Q13888 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GTF2H2Q13888 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GTF2H2Q13888 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GTF2H2Q13888 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GTF2H2Q13888 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GTF2H2Q13888 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GTF2H2Q13888 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GTF2H2Q13888 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GTF2H2Q13888 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GTF2H2Q13888 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GTF2H2Q13888 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GTF2H2Q13888 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GTF2H2Q13888 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GTF2H2Q13888 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GTF2H2Q13888 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GTF2H2Q13888 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GTF2H2Q13888 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GTF2H2Q13888 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GTF2H2Q13888 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GTF2H2Q13888 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GTF2H2Q13888 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GTF2H2Q13888 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GTF2H2Q13888 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GTF2H2Q13888 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GTF2H2Q13888 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GTF2H2Q13888 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GTF2H2Q13888 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms