Protein–RNA interactions for Protein: Q13790

APOF, Apolipoprotein F, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOFQ13790 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
APOFQ13790 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
APOFQ13790 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
APOFQ13790 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
APOFQ13790 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
APOFQ13790 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
APOFQ13790 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
APOFQ13790 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
APOFQ13790 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
APOFQ13790 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
APOFQ13790 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
APOFQ13790 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
APOFQ13790 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
APOFQ13790 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
APOFQ13790 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
APOFQ13790 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
APOFQ13790 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
APOFQ13790 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
APOFQ13790 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
APOFQ13790 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
APOFQ13790 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
APOFQ13790 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
APOFQ13790 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
APOFQ13790 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
APOFQ13790 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
APOFQ13790 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
APOFQ13790 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
APOFQ13790 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
APOFQ13790 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
APOFQ13790 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
APOFQ13790 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
APOFQ13790 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
APOFQ13790 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
APOFQ13790 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
APOFQ13790 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
APOFQ13790 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
APOFQ13790 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
APOFQ13790 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
APOFQ13790 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
APOFQ13790 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
APOFQ13790 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
APOFQ13790 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
APOFQ13790 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
APOFQ13790 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
APOFQ13790 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
APOFQ13790 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
APOFQ13790 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
APOFQ13790 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
APOFQ13790 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
APOFQ13790 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
APOFQ13790 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
APOFQ13790 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
APOFQ13790 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
APOFQ13790 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
APOFQ13790 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
APOFQ13790 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
APOFQ13790 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
APOFQ13790 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
APOFQ13790 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
APOFQ13790 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
APOFQ13790 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
APOFQ13790 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
APOFQ13790 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
APOFQ13790 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
APOFQ13790 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
APOFQ13790 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
APOFQ13790 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
APOFQ13790 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
APOFQ13790 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
APOFQ13790 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
APOFQ13790 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
APOFQ13790 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
APOFQ13790 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
APOFQ13790 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
APOFQ13790 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
APOFQ13790 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
APOFQ13790 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
APOFQ13790 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
APOFQ13790 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
APOFQ13790 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
APOFQ13790 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
APOFQ13790 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
APOFQ13790 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
APOFQ13790 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
APOFQ13790 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
APOFQ13790 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
APOFQ13790 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
APOFQ13790 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
APOFQ13790 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
APOFQ13790 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
APOFQ13790 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
APOFQ13790 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
APOFQ13790 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
APOFQ13790 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
APOFQ13790 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
APOFQ13790 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
APOFQ13790 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
APOFQ13790 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
APOFQ13790 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
APOFQ13790 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
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