Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

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Length 913 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CUL4BQ13620 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CUL4BQ13620 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CUL4BQ13620 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CUL4BQ13620 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CUL4BQ13620 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CUL4BQ13620 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CUL4BQ13620 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CUL4BQ13620 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CUL4BQ13620 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CUL4BQ13620 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CUL4BQ13620 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CUL4BQ13620 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CUL4BQ13620 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CUL4BQ13620 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CUL4BQ13620 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CUL4BQ13620 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CUL4BQ13620 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CUL4BQ13620 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CUL4BQ13620 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CUL4BQ13620 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CUL4BQ13620 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CUL4BQ13620 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CUL4BQ13620 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CUL4BQ13620 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CUL4BQ13620 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CUL4BQ13620 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CUL4BQ13620 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CUL4BQ13620 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CUL4BQ13620 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CUL4BQ13620 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CUL4BQ13620 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CUL4BQ13620 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CUL4BQ13620 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CUL4BQ13620 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CUL4BQ13620 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CUL4BQ13620 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CUL4BQ13620 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CUL4BQ13620 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CUL4BQ13620 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CUL4BQ13620 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CUL4BQ13620 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CUL4BQ13620 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CUL4BQ13620 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CUL4BQ13620 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CUL4BQ13620 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CUL4BQ13620 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CUL4BQ13620 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CUL4BQ13620 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CUL4BQ13620 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CUL4BQ13620 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CUL4BQ13620 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CUL4BQ13620 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CUL4BQ13620 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CUL4BQ13620 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CUL4BQ13620 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CUL4BQ13620 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CUL4BQ13620 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CUL4BQ13620 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CUL4BQ13620 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CUL4BQ13620 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CUL4BQ13620 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CUL4BQ13620 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CUL4BQ13620 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CUL4BQ13620 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CUL4BQ13620 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CUL4BQ13620 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CUL4BQ13620 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CUL4BQ13620 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CUL4BQ13620 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CUL4BQ13620 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CUL4BQ13620 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CUL4BQ13620 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CUL4BQ13620 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CUL4BQ13620 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CUL4BQ13620 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CUL4BQ13620 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CUL4BQ13620 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CUL4BQ13620 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CUL4BQ13620 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CUL4BQ13620 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CUL4BQ13620 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CUL4BQ13620 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CUL4BQ13620 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CUL4BQ13620 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CUL4BQ13620 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
CUL4BQ13620 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CUL4BQ13620 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CUL4BQ13620 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CUL4BQ13620 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CUL4BQ13620 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CUL4BQ13620 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
CUL4BQ13620 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CUL4BQ13620 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CUL4BQ13620 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CUL4BQ13620 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CUL4BQ13620 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CUL4BQ13620 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CUL4BQ13620 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CUL4BQ13620 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
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