Protein–RNA interactions for Protein: Q13608

PEX6, Peroxisome assembly factor 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX6Q13608 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PEX6Q13608 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PEX6Q13608 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PEX6Q13608 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PEX6Q13608 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PEX6Q13608 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PEX6Q13608 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PEX6Q13608 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PEX6Q13608 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PEX6Q13608 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PEX6Q13608 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PEX6Q13608 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PEX6Q13608 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PEX6Q13608 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
PEX6Q13608 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PEX6Q13608 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PEX6Q13608 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
PEX6Q13608 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PEX6Q13608 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
PEX6Q13608 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PEX6Q13608 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PEX6Q13608 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PEX6Q13608 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
PEX6Q13608 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PEX6Q13608 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PEX6Q13608 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PEX6Q13608 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PEX6Q13608 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PEX6Q13608 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PEX6Q13608 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PEX6Q13608 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PEX6Q13608 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PEX6Q13608 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PEX6Q13608 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PEX6Q13608 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PEX6Q13608 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
PEX6Q13608 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PEX6Q13608 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PEX6Q13608 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PEX6Q13608 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PEX6Q13608 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PEX6Q13608 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PEX6Q13608 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PEX6Q13608 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PEX6Q13608 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
PEX6Q13608 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PEX6Q13608 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PEX6Q13608 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PEX6Q13608 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PEX6Q13608 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PEX6Q13608 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PEX6Q13608 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PEX6Q13608 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PEX6Q13608 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PEX6Q13608 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PEX6Q13608 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PEX6Q13608 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
PEX6Q13608 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
PEX6Q13608 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PEX6Q13608 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PEX6Q13608 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
PEX6Q13608 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PEX6Q13608 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
PEX6Q13608 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
PEX6Q13608 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
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PEX6Q13608 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PEX6Q13608 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PEX6Q13608 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PEX6Q13608 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PEX6Q13608 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PEX6Q13608 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PEX6Q13608 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
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PEX6Q13608 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
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PEX6Q13608 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
PEX6Q13608 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PEX6Q13608 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PEX6Q13608 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PEX6Q13608 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PEX6Q13608 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PEX6Q13608 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PEX6Q13608 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PEX6Q13608 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PEX6Q13608 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PEX6Q13608 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PEX6Q13608 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PEX6Q13608 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PEX6Q13608 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PEX6Q13608 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PEX6Q13608 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PEX6Q13608 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PEX6Q13608 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PEX6Q13608 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PEX6Q13608 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PEX6Q13608 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
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