Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LSAMPQ13449 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
LSAMPQ13449 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LSAMPQ13449 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
LSAMPQ13449 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
LSAMPQ13449 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.38
LSAMPQ13449 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
LSAMPQ13449 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
LSAMPQ13449 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
LSAMPQ13449 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
LSAMPQ13449 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LSAMPQ13449 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LSAMPQ13449 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LSAMPQ13449 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LSAMPQ13449 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LSAMPQ13449 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LSAMPQ13449 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LSAMPQ13449 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LSAMPQ13449 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LSAMPQ13449 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LSAMPQ13449 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LSAMPQ13449 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
LSAMPQ13449 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LSAMPQ13449 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LSAMPQ13449 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LSAMPQ13449 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LSAMPQ13449 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
LSAMPQ13449 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LSAMPQ13449 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LSAMPQ13449 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LSAMPQ13449 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LSAMPQ13449 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LSAMPQ13449 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LSAMPQ13449 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LSAMPQ13449 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LSAMPQ13449 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LSAMPQ13449 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LSAMPQ13449 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LSAMPQ13449 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LSAMPQ13449 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LSAMPQ13449 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LSAMPQ13449 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LSAMPQ13449 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LSAMPQ13449 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LSAMPQ13449 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LSAMPQ13449 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LSAMPQ13449 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LSAMPQ13449 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LSAMPQ13449 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LSAMPQ13449 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LSAMPQ13449 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LSAMPQ13449 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LSAMPQ13449 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LSAMPQ13449 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LSAMPQ13449 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LSAMPQ13449 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LSAMPQ13449 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LSAMPQ13449 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LSAMPQ13449 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LSAMPQ13449 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
LSAMPQ13449 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LSAMPQ13449 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LSAMPQ13449 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LSAMPQ13449 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LSAMPQ13449 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LSAMPQ13449 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LSAMPQ13449 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LSAMPQ13449 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LSAMPQ13449 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LSAMPQ13449 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LSAMPQ13449 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LSAMPQ13449 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LSAMPQ13449 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LSAMPQ13449 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LSAMPQ13449 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LSAMPQ13449 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
LSAMPQ13449 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LSAMPQ13449 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LSAMPQ13449 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LSAMPQ13449 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LSAMPQ13449 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LSAMPQ13449 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LSAMPQ13449 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LSAMPQ13449 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LSAMPQ13449 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LSAMPQ13449 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LSAMPQ13449 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LSAMPQ13449 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LSAMPQ13449 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
LSAMPQ13449 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LSAMPQ13449 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LSAMPQ13449 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
LSAMPQ13449 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LSAMPQ13449 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LSAMPQ13449 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LSAMPQ13449 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LSAMPQ13449 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LSAMPQ13449 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LSAMPQ13449 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LSAMPQ13449 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 120.1 ms