Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
DUSP4Q13115 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
DUSP4Q13115 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
DUSP4Q13115 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
DUSP4Q13115 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
DUSP4Q13115 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
DUSP4Q13115 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
DUSP4Q13115 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
DUSP4Q13115 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
DUSP4Q13115 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
DUSP4Q13115 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
DUSP4Q13115 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
DUSP4Q13115 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
DUSP4Q13115 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
DUSP4Q13115 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
DUSP4Q13115 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
DUSP4Q13115 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
DUSP4Q13115 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
DUSP4Q13115 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
DUSP4Q13115 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
DUSP4Q13115 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
DUSP4Q13115 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DUSP4Q13115 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DUSP4Q13115 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DUSP4Q13115 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DUSP4Q13115 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DUSP4Q13115 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
DUSP4Q13115 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DUSP4Q13115 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DUSP4Q13115 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DUSP4Q13115 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DUSP4Q13115 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DUSP4Q13115 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DUSP4Q13115 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DUSP4Q13115 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DUSP4Q13115 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DUSP4Q13115 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
DUSP4Q13115 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
DUSP4Q13115 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DUSP4Q13115 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DUSP4Q13115 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DUSP4Q13115 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DUSP4Q13115 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DUSP4Q13115 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DUSP4Q13115 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DUSP4Q13115 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DUSP4Q13115 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
DUSP4Q13115 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DUSP4Q13115 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DUSP4Q13115 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DUSP4Q13115 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DUSP4Q13115 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
DUSP4Q13115 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DUSP4Q13115 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
DUSP4Q13115 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
DUSP4Q13115 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DUSP4Q13115 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
DUSP4Q13115 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DUSP4Q13115 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DUSP4Q13115 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
DUSP4Q13115 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DUSP4Q13115 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
DUSP4Q13115 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
DUSP4Q13115 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
DUSP4Q13115 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
DUSP4Q13115 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
DUSP4Q13115 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DUSP4Q13115 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DUSP4Q13115 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
DUSP4Q13115 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DUSP4Q13115 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
DUSP4Q13115 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
DUSP4Q13115 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
DUSP4Q13115 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
DUSP4Q13115 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
DUSP4Q13115 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
DUSP4Q13115 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
DUSP4Q13115 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
DUSP4Q13115 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
DUSP4Q13115 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
DUSP4Q13115 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
DUSP4Q13115 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
DUSP4Q13115 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
DUSP4Q13115 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
DUSP4Q13115 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
DUSP4Q13115 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
DUSP4Q13115 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
DUSP4Q13115 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
DUSP4Q13115 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
DUSP4Q13115 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
DUSP4Q13115 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
DUSP4Q13115 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
DUSP4Q13115 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
DUSP4Q13115 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
DUSP4Q13115 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
DUSP4Q13115 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
DUSP4Q13115 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
DUSP4Q13115 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
DUSP4Q13115 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
DUSP4Q13115 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
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