Protein–RNA interactions for Protein: Q13011

ECH1, Delta(3,5)-Delta(2,4)-dienoyl-CoA isomerase, mitochondrial, humanhuman

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECH1Q13011 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ECH1Q13011 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ECH1Q13011 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
ECH1Q13011 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ECH1Q13011 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ECH1Q13011 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ECH1Q13011 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ECH1Q13011 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ECH1Q13011 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ECH1Q13011 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ECH1Q13011 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ECH1Q13011 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ECH1Q13011 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ECH1Q13011 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ECH1Q13011 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ECH1Q13011 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ECH1Q13011 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ECH1Q13011 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ECH1Q13011 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ECH1Q13011 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
ECH1Q13011 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ECH1Q13011 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ECH1Q13011 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ECH1Q13011 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ECH1Q13011 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ECH1Q13011 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ECH1Q13011 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ECH1Q13011 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ECH1Q13011 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ECH1Q13011 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ECH1Q13011 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ECH1Q13011 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ECH1Q13011 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
ECH1Q13011 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ECH1Q13011 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ECH1Q13011 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ECH1Q13011 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ECH1Q13011 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ECH1Q13011 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ECH1Q13011 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ECH1Q13011 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ECH1Q13011 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ECH1Q13011 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ECH1Q13011 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ECH1Q13011 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ECH1Q13011 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ECH1Q13011 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ECH1Q13011 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
ECH1Q13011 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ECH1Q13011 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ECH1Q13011 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ECH1Q13011 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ECH1Q13011 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ECH1Q13011 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ECH1Q13011 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ECH1Q13011 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ECH1Q13011 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ECH1Q13011 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ECH1Q13011 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ECH1Q13011 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ECH1Q13011 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ECH1Q13011 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ECH1Q13011 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ECH1Q13011 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ECH1Q13011 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ECH1Q13011 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ECH1Q13011 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
ECH1Q13011 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
ECH1Q13011 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ECH1Q13011 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ECH1Q13011 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ECH1Q13011 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ECH1Q13011 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ECH1Q13011 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ECH1Q13011 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ECH1Q13011 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ECH1Q13011 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ECH1Q13011 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ECH1Q13011 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ECH1Q13011 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ECH1Q13011 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ECH1Q13011 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ECH1Q13011 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ECH1Q13011 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ECH1Q13011 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ECH1Q13011 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ECH1Q13011 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ECH1Q13011 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ECH1Q13011 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ECH1Q13011 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ECH1Q13011 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ECH1Q13011 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ECH1Q13011 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ECH1Q13011 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ECH1Q13011 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ECH1Q13011 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ECH1Q13011 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ECH1Q13011 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ECH1Q13011 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ECH1Q13011 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
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