Protein–RNA interactions for Protein: Q08499

PDE4D, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4D, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4DQ08499 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PDE4DQ08499 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PDE4DQ08499 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PDE4DQ08499 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PDE4DQ08499 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PDE4DQ08499 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PDE4DQ08499 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PDE4DQ08499 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PDE4DQ08499 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PDE4DQ08499 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PDE4DQ08499 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PDE4DQ08499 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PDE4DQ08499 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PDE4DQ08499 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PDE4DQ08499 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PDE4DQ08499 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PDE4DQ08499 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PDE4DQ08499 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PDE4DQ08499 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PDE4DQ08499 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PDE4DQ08499 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PDE4DQ08499 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PDE4DQ08499 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PDE4DQ08499 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PDE4DQ08499 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PDE4DQ08499 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PDE4DQ08499 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
PDE4DQ08499 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PDE4DQ08499 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PDE4DQ08499 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PDE4DQ08499 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PDE4DQ08499 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PDE4DQ08499 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PDE4DQ08499 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PDE4DQ08499 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PDE4DQ08499 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PDE4DQ08499 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PDE4DQ08499 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PDE4DQ08499 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PDE4DQ08499 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PDE4DQ08499 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PDE4DQ08499 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PDE4DQ08499 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PDE4DQ08499 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PDE4DQ08499 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PDE4DQ08499 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PDE4DQ08499 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PDE4DQ08499 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PDE4DQ08499 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PDE4DQ08499 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PDE4DQ08499 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PDE4DQ08499 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PDE4DQ08499 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PDE4DQ08499 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PDE4DQ08499 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PDE4DQ08499 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PDE4DQ08499 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PDE4DQ08499 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PDE4DQ08499 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PDE4DQ08499 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PDE4DQ08499 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PDE4DQ08499 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PDE4DQ08499 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PDE4DQ08499 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PDE4DQ08499 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PDE4DQ08499 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PDE4DQ08499 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PDE4DQ08499 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PDE4DQ08499 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PDE4DQ08499 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PDE4DQ08499 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PDE4DQ08499 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
PDE4DQ08499 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PDE4DQ08499 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PDE4DQ08499 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PDE4DQ08499 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PDE4DQ08499 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PDE4DQ08499 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PDE4DQ08499 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PDE4DQ08499 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
PDE4DQ08499 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PDE4DQ08499 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
PDE4DQ08499 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PDE4DQ08499 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PDE4DQ08499 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PDE4DQ08499 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
PDE4DQ08499 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
PDE4DQ08499 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
PDE4DQ08499 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PDE4DQ08499 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
PDE4DQ08499 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PDE4DQ08499 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PDE4DQ08499 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PDE4DQ08499 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PDE4DQ08499 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PDE4DQ08499 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PDE4DQ08499 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PDE4DQ08499 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PDE4DQ08499 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PDE4DQ08499 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms