Protein–RNA interactions for Protein: Q05655

PRKCD, Protein kinase C delta type, humanhuman

Predictions only

Length 676 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCDQ05655 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PRKCDQ05655 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PRKCDQ05655 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PRKCDQ05655 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
PRKCDQ05655 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PRKCDQ05655 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PRKCDQ05655 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PRKCDQ05655 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PRKCDQ05655 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PRKCDQ05655 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PRKCDQ05655 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
PRKCDQ05655 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PRKCDQ05655 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PRKCDQ05655 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PRKCDQ05655 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PRKCDQ05655 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PRKCDQ05655 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
PRKCDQ05655 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PRKCDQ05655 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PRKCDQ05655 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PRKCDQ05655 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PRKCDQ05655 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PRKCDQ05655 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PRKCDQ05655 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PRKCDQ05655 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PRKCDQ05655 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PRKCDQ05655 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PRKCDQ05655 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PRKCDQ05655 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PRKCDQ05655 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PRKCDQ05655 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PRKCDQ05655 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PRKCDQ05655 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PRKCDQ05655 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PRKCDQ05655 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PRKCDQ05655 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PRKCDQ05655 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PRKCDQ05655 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PRKCDQ05655 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PRKCDQ05655 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PRKCDQ05655 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PRKCDQ05655 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PRKCDQ05655 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PRKCDQ05655 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PRKCDQ05655 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PRKCDQ05655 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PRKCDQ05655 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PRKCDQ05655 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PRKCDQ05655 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PRKCDQ05655 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PRKCDQ05655 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PRKCDQ05655 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PRKCDQ05655 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
PRKCDQ05655 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PRKCDQ05655 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PRKCDQ05655 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PRKCDQ05655 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PRKCDQ05655 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PRKCDQ05655 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PRKCDQ05655 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PRKCDQ05655 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PRKCDQ05655 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PRKCDQ05655 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PRKCDQ05655 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PRKCDQ05655 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PRKCDQ05655 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PRKCDQ05655 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PRKCDQ05655 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PRKCDQ05655 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PRKCDQ05655 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PRKCDQ05655 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PRKCDQ05655 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PRKCDQ05655 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PRKCDQ05655 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PRKCDQ05655 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PRKCDQ05655 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PRKCDQ05655 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PRKCDQ05655 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PRKCDQ05655 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PRKCDQ05655 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PRKCDQ05655 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PRKCDQ05655 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PRKCDQ05655 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
PRKCDQ05655 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
PRKCDQ05655 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
PRKCDQ05655 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PRKCDQ05655 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
PRKCDQ05655 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PRKCDQ05655 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PRKCDQ05655 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PRKCDQ05655 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PRKCDQ05655 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PRKCDQ05655 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PRKCDQ05655 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PRKCDQ05655 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PRKCDQ05655 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PRKCDQ05655 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PRKCDQ05655 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PRKCDQ05655 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PRKCDQ05655 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms