Protein–RNA interactions for Protein: Q04656

ATP7A, Copper-transporting ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP7AQ04656 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
ATP7AQ04656 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
ATP7AQ04656 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
ATP7AQ04656 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
ATP7AQ04656 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
ATP7AQ04656 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
ATP7AQ04656 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
ATP7AQ04656 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
ATP7AQ04656 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
ATP7AQ04656 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ATP7AQ04656 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ATP7AQ04656 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
ATP7AQ04656 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ATP7AQ04656 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ATP7AQ04656 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ATP7AQ04656 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ATP7AQ04656 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ATP7AQ04656 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ATP7AQ04656 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ATP7AQ04656 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ATP7AQ04656 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ATP7AQ04656 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ATP7AQ04656 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ATP7AQ04656 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
ATP7AQ04656 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ATP7AQ04656 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ATP7AQ04656 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ATP7AQ04656 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ATP7AQ04656 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ATP7AQ04656 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ATP7AQ04656 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ATP7AQ04656 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ATP7AQ04656 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ATP7AQ04656 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ATP7AQ04656 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ATP7AQ04656 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ATP7AQ04656 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ATP7AQ04656 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ATP7AQ04656 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ATP7AQ04656 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ATP7AQ04656 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ATP7AQ04656 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ATP7AQ04656 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ATP7AQ04656 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ATP7AQ04656 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ATP7AQ04656 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ATP7AQ04656 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ATP7AQ04656 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ATP7AQ04656 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ATP7AQ04656 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ATP7AQ04656 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ATP7AQ04656 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ATP7AQ04656 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ATP7AQ04656 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ATP7AQ04656 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ATP7AQ04656 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ATP7AQ04656 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ATP7AQ04656 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ATP7AQ04656 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ATP7AQ04656 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ATP7AQ04656 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ATP7AQ04656 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ATP7AQ04656 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ATP7AQ04656 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ATP7AQ04656 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ATP7AQ04656 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ATP7AQ04656 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ATP7AQ04656 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ATP7AQ04656 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ATP7AQ04656 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ATP7AQ04656 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
ATP7AQ04656 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ATP7AQ04656 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ATP7AQ04656 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ATP7AQ04656 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ATP7AQ04656 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ATP7AQ04656 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ATP7AQ04656 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ATP7AQ04656 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
ATP7AQ04656 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ATP7AQ04656 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ATP7AQ04656 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ATP7AQ04656 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ATP7AQ04656 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ATP7AQ04656 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
ATP7AQ04656 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ATP7AQ04656 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
ATP7AQ04656 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
ATP7AQ04656 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
ATP7AQ04656 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
ATP7AQ04656 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
ATP7AQ04656 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
ATP7AQ04656 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
ATP7AQ04656 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ATP7AQ04656 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
ATP7AQ04656 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
ATP7AQ04656 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
ATP7AQ04656 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
ATP7AQ04656 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ATP7AQ04656 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms