Protein–RNA interactions for Protein: Q02413

DSG1, Desmoglein-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,049 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSG1Q02413 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
DSG1Q02413 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
DSG1Q02413 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
DSG1Q02413 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
DSG1Q02413 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
DSG1Q02413 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
DSG1Q02413 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
DSG1Q02413 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
DSG1Q02413 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
DSG1Q02413 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
DSG1Q02413 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
DSG1Q02413 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
DSG1Q02413 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
DSG1Q02413 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
DSG1Q02413 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
DSG1Q02413 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
DSG1Q02413 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
DSG1Q02413 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
DSG1Q02413 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
DSG1Q02413 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
DSG1Q02413 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
DSG1Q02413 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
DSG1Q02413 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
DSG1Q02413 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
DSG1Q02413 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
DSG1Q02413 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
DSG1Q02413 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
DSG1Q02413 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
DSG1Q02413 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
DSG1Q02413 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
DSG1Q02413 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
DSG1Q02413 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
DSG1Q02413 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
DSG1Q02413 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
DSG1Q02413 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
DSG1Q02413 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
DSG1Q02413 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
DSG1Q02413 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
DSG1Q02413 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
DSG1Q02413 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
DSG1Q02413 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
DSG1Q02413 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
DSG1Q02413 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
DSG1Q02413 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
DSG1Q02413 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
DSG1Q02413 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
DSG1Q02413 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
DSG1Q02413 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
DSG1Q02413 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
DSG1Q02413 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
DSG1Q02413 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
DSG1Q02413 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
DSG1Q02413 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
DSG1Q02413 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
DSG1Q02413 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
DSG1Q02413 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
DSG1Q02413 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
DSG1Q02413 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
DSG1Q02413 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
DSG1Q02413 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
DSG1Q02413 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
DSG1Q02413 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
DSG1Q02413 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
DSG1Q02413 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
DSG1Q02413 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
DSG1Q02413 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
DSG1Q02413 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
DSG1Q02413 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
DSG1Q02413 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
DSG1Q02413 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
DSG1Q02413 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
DSG1Q02413 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
DSG1Q02413 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
DSG1Q02413 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
DSG1Q02413 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
DSG1Q02413 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
DSG1Q02413 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
DSG1Q02413 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
DSG1Q02413 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
DSG1Q02413 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
DSG1Q02413 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
DSG1Q02413 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
DSG1Q02413 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
DSG1Q02413 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
DSG1Q02413 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
DSG1Q02413 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
DSG1Q02413 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
DSG1Q02413 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
DSG1Q02413 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
DSG1Q02413 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
DSG1Q02413 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
DSG1Q02413 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
DSG1Q02413 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
DSG1Q02413 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
DSG1Q02413 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
DSG1Q02413 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
DSG1Q02413 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
DSG1Q02413 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
DSG1Q02413 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
DSG1Q02413 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms