Protein–RNA interactions for Protein: P62987

UBA52, Ubiquitin-60S ribosomal protein L40, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBA52P62987 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBA52P62987 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBA52P62987 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBA52P62987 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBA52P62987 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBA52P62987 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBA52P62987 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBA52P62987 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBA52P62987 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBA52P62987 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBA52P62987 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBA52P62987 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBA52P62987 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBA52P62987 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBA52P62987 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBA52P62987 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
UBA52P62987 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBA52P62987 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBA52P62987 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBA52P62987 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBA52P62987 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBA52P62987 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBA52P62987 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBA52P62987 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
UBA52P62987 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBA52P62987 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBA52P62987 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBA52P62987 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBA52P62987 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBA52P62987 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBA52P62987 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBA52P62987 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBA52P62987 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBA52P62987 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBA52P62987 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBA52P62987 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBA52P62987 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBA52P62987 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBA52P62987 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBA52P62987 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBA52P62987 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBA52P62987 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBA52P62987 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBA52P62987 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBA52P62987 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBA52P62987 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBA52P62987 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
UBA52P62987 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBA52P62987 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBA52P62987 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBA52P62987 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBA52P62987 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBA52P62987 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBA52P62987 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBA52P62987 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBA52P62987 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBA52P62987 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBA52P62987 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBA52P62987 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBA52P62987 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBA52P62987 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBA52P62987 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBA52P62987 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBA52P62987 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBA52P62987 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBA52P62987 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBA52P62987 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBA52P62987 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBA52P62987 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBA52P62987 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBA52P62987 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBA52P62987 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBA52P62987 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBA52P62987 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBA52P62987 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBA52P62987 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBA52P62987 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBA52P62987 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBA52P62987 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBA52P62987 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBA52P62987 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBA52P62987 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBA52P62987 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBA52P62987 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBA52P62987 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBA52P62987 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBA52P62987 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBA52P62987 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBA52P62987 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBA52P62987 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBA52P62987 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBA52P62987 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBA52P62987 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBA52P62987 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBA52P62987 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBA52P62987 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBA52P62987 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBA52P62987 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBA52P62987 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBA52P62987 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms