Protein–RNA interactions for Protein: P61574

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Rec protein, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P61574 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HERVK_113P61574 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HERVK_113P61574 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HERVK_113P61574 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HERVK_113P61574 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HERVK_113P61574 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HERVK_113P61574 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HERVK_113P61574 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HERVK_113P61574 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HERVK_113P61574 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HERVK_113P61574 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HERVK_113P61574 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HERVK_113P61574 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HERVK_113P61574 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HERVK_113P61574 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HERVK_113P61574 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HERVK_113P61574 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HERVK_113P61574 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HERVK_113P61574 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HERVK_113P61574 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HERVK_113P61574 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HERVK_113P61574 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HERVK_113P61574 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HERVK_113P61574 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HERVK_113P61574 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HERVK_113P61574 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HERVK_113P61574 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HERVK_113P61574 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HERVK_113P61574 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HERVK_113P61574 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HERVK_113P61574 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HERVK_113P61574 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HERVK_113P61574 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HERVK_113P61574 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HERVK_113P61574 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HERVK_113P61574 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HERVK_113P61574 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HERVK_113P61574 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HERVK_113P61574 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HERVK_113P61574 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HERVK_113P61574 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HERVK_113P61574 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HERVK_113P61574 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HERVK_113P61574 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HERVK_113P61574 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HERVK_113P61574 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HERVK_113P61574 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HERVK_113P61574 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HERVK_113P61574 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HERVK_113P61574 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HERVK_113P61574 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HERVK_113P61574 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HERVK_113P61574 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HERVK_113P61574 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HERVK_113P61574 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HERVK_113P61574 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HERVK_113P61574 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HERVK_113P61574 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HERVK_113P61574 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HERVK_113P61574 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HERVK_113P61574 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HERVK_113P61574 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HERVK_113P61574 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HERVK_113P61574 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HERVK_113P61574 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HERVK_113P61574 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HERVK_113P61574 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HERVK_113P61574 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HERVK_113P61574 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HERVK_113P61574 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HERVK_113P61574 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HERVK_113P61574 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
HERVK_113P61574 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HERVK_113P61574 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HERVK_113P61574 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HERVK_113P61574 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HERVK_113P61574 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HERVK_113P61574 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HERVK_113P61574 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HERVK_113P61574 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HERVK_113P61574 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HERVK_113P61574 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HERVK_113P61574 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HERVK_113P61574 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HERVK_113P61574 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HERVK_113P61574 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HERVK_113P61574 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HERVK_113P61574 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HERVK_113P61574 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HERVK_113P61574 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
HERVK_113P61574 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
HERVK_113P61574 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
HERVK_113P61574 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
HERVK_113P61574 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
HERVK_113P61574 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
HERVK_113P61574 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
HERVK_113P61574 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
HERVK_113P61574 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
HERVK_113P61574 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
HERVK_113P61574 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms