Protein–RNA interactions for Protein: P61165

TMEM258, Transmembrane protein 258, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM258P61165 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
TMEM258P61165 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
TMEM258P61165 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
TMEM258P61165 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
TMEM258P61165 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
TMEM258P61165 CHRNA7-201ENST00000306901 6181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
TMEM258P61165 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
TMEM258P61165 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
TMEM258P61165 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
TMEM258P61165 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
TMEM258P61165 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
TMEM258P61165 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
TMEM258P61165 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
TMEM258P61165 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
TMEM258P61165 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
TMEM258P61165 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
TMEM258P61165 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
TMEM258P61165 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
TMEM258P61165 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
TMEM258P61165 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
TMEM258P61165 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
TMEM258P61165 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
TMEM258P61165 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
TMEM258P61165 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
TMEM258P61165 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
TMEM258P61165 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
TMEM258P61165 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
TMEM258P61165 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
TMEM258P61165 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
TMEM258P61165 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
TMEM258P61165 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
TMEM258P61165 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
TMEM258P61165 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
TMEM258P61165 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
TMEM258P61165 AC005324.3-201ENST00000455584 5514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
TMEM258P61165 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
TMEM258P61165 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
TMEM258P61165 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
TMEM258P61165 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
TMEM258P61165 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
TMEM258P61165 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
TMEM258P61165 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
TMEM258P61165 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
TMEM258P61165 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
TMEM258P61165 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
TMEM258P61165 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
TMEM258P61165 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
TMEM258P61165 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
TMEM258P61165 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
TMEM258P61165 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
TMEM258P61165 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
TMEM258P61165 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
TMEM258P61165 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
TMEM258P61165 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
TMEM258P61165 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
TMEM258P61165 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
TMEM258P61165 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
TMEM258P61165 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
TMEM258P61165 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
TMEM258P61165 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
TMEM258P61165 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
TMEM258P61165 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
TMEM258P61165 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
TMEM258P61165 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
TMEM258P61165 GRM1-203ENST00000361719 6754 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
TMEM258P61165 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
TMEM258P61165 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
TMEM258P61165 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
TMEM258P61165 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
TMEM258P61165 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
TMEM258P61165 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
TMEM258P61165 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
TMEM258P61165 CSPG4-201ENST00000308508 8290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
TMEM258P61165 GRAMD4-202ENST00000406902 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
TMEM258P61165 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
TMEM258P61165 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
TMEM258P61165 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
TMEM258P61165 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
TMEM258P61165 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC11.43□□□□□ -0.58
TMEM258P61165 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
TMEM258P61165 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
TMEM258P61165 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
TMEM258P61165 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
TMEM258P61165 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
TMEM258P61165 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
TMEM258P61165 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
TMEM258P61165 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
TMEM258P61165 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
TMEM258P61165 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
TMEM258P61165 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
TMEM258P61165 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
TMEM258P61165 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
TMEM258P61165 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
TMEM258P61165 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
TMEM258P61165 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
TMEM258P61165 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
TMEM258P61165 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
TMEM258P61165 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
TMEM258P61165 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.42□□□□□ -0.58
TMEM258P61165 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms