Protein–RNA interactions for Protein: P60602

ROMO1, Reactive oxygen species modulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROMO1P60602 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.88□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC8.88□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC8.88□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.88□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC8.88□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC8.88□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC8.88□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.88□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 SLIT1-201ENST00000266058 7925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.88□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8.88□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC8.87□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC8.87□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 ARFGAP1-212ENST00000519604 3191 ntTSL 2 BASIC8.87□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.87□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.87□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.87□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC8.87□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 CSPG4P12-202ENST00000559989 7790 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC8.87□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC8.87□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC8.87□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.87□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC8.87□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC8.87□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC8.87□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.87□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 LINC00926-202ENST00000502027 2141 ntTSL 2 BASIC8.87□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC8.87□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.87□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC8.87□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC8.87□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 PANX2-202ENST00000395842 3051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.86□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC8.86□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms