Protein–RNA interactions for Protein: P56180

TPTE, Putative tyrosine-protein phosphatase TPTE, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPTEP56180 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TPTEP56180 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TPTEP56180 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TPTEP56180 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TPTEP56180 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TPTEP56180 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TPTEP56180 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TPTEP56180 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TPTEP56180 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TPTEP56180 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TPTEP56180 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TPTEP56180 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TPTEP56180 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TPTEP56180 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TPTEP56180 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TPTEP56180 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TPTEP56180 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TPTEP56180 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TPTEP56180 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TPTEP56180 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
TPTEP56180 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TPTEP56180 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TPTEP56180 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TPTEP56180 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TPTEP56180 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TPTEP56180 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TPTEP56180 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TPTEP56180 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TPTEP56180 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TPTEP56180 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TPTEP56180 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TPTEP56180 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TPTEP56180 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TPTEP56180 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TPTEP56180 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TPTEP56180 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TPTEP56180 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TPTEP56180 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TPTEP56180 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TPTEP56180 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TPTEP56180 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TPTEP56180 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TPTEP56180 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TPTEP56180 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TPTEP56180 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TPTEP56180 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TPTEP56180 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TPTEP56180 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TPTEP56180 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TPTEP56180 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TPTEP56180 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TPTEP56180 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TPTEP56180 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TPTEP56180 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TPTEP56180 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TPTEP56180 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TPTEP56180 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TPTEP56180 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TPTEP56180 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TPTEP56180 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TPTEP56180 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
TPTEP56180 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TPTEP56180 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TPTEP56180 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TPTEP56180 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TPTEP56180 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TPTEP56180 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TPTEP56180 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TPTEP56180 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TPTEP56180 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TPTEP56180 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
TPTEP56180 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TPTEP56180 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TPTEP56180 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TPTEP56180 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TPTEP56180 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TPTEP56180 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TPTEP56180 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TPTEP56180 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TPTEP56180 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TPTEP56180 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TPTEP56180 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TPTEP56180 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TPTEP56180 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TPTEP56180 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TPTEP56180 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TPTEP56180 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TPTEP56180 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TPTEP56180 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TPTEP56180 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TPTEP56180 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TPTEP56180 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TPTEP56180 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TPTEP56180 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TPTEP56180 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TPTEP56180 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TPTEP56180 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TPTEP56180 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TPTEP56180 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TPTEP56180 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms