Protein–RNA interactions for Protein: P55211

CASP9, Caspase-9, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP9P55211 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CASP9P55211 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CASP9P55211 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CASP9P55211 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CASP9P55211 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CASP9P55211 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CASP9P55211 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CASP9P55211 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CASP9P55211 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CASP9P55211 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CASP9P55211 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CASP9P55211 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CASP9P55211 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CASP9P55211 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CASP9P55211 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CASP9P55211 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CASP9P55211 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CASP9P55211 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CASP9P55211 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CASP9P55211 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CASP9P55211 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CASP9P55211 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CASP9P55211 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CASP9P55211 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CASP9P55211 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CASP9P55211 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CASP9P55211 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CASP9P55211 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CASP9P55211 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CASP9P55211 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CASP9P55211 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CASP9P55211 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CASP9P55211 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CASP9P55211 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CASP9P55211 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CASP9P55211 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CASP9P55211 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CASP9P55211 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CASP9P55211 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CASP9P55211 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CASP9P55211 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CASP9P55211 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CASP9P55211 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CASP9P55211 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CASP9P55211 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CASP9P55211 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CASP9P55211 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CASP9P55211 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CASP9P55211 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CASP9P55211 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CASP9P55211 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CASP9P55211 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CASP9P55211 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CASP9P55211 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CASP9P55211 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CASP9P55211 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CASP9P55211 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CASP9P55211 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CASP9P55211 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CASP9P55211 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CASP9P55211 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CASP9P55211 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CASP9P55211 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CASP9P55211 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CASP9P55211 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CASP9P55211 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CASP9P55211 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CASP9P55211 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CASP9P55211 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CASP9P55211 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CASP9P55211 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CASP9P55211 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CASP9P55211 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CASP9P55211 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CASP9P55211 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CASP9P55211 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CASP9P55211 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CASP9P55211 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CASP9P55211 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CASP9P55211 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CASP9P55211 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CASP9P55211 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CASP9P55211 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CASP9P55211 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CASP9P55211 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CASP9P55211 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CASP9P55211 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CASP9P55211 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CASP9P55211 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CASP9P55211 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CASP9P55211 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CASP9P55211 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CASP9P55211 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CASP9P55211 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CASP9P55211 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CASP9P55211 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CASP9P55211 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CASP9P55211 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CASP9P55211 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CASP9P55211 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms